植物学2011年年会论文摘要汇编.doc

新疆紫草科DNA条形码研究及其系统发育分析 高晓阳1,2 梁 雪1 李 岩1,2 刘 斌1,2 中科院新疆生态与地理研究所系统基因组研究中心，乌鲁木齐，830011 中国科学院研究生院，北京，100049 新疆紫草科种类繁多，具有重要的药用及生物学价值，但其形态学、孢粉学、化学分类上存在一定的不确定性。DNA条形码技术作为物种快速准确鉴定方法，成为分子分类学研究的新兴领域。本文采用叶绿体基因rbcL为目的片段，对紫草科植物进行总DNA提取，PRC扩增和产物测序，结合GenBank数据库紫草科rbcL序列，通过属内属间遗传距离差异性比较，同时以亲缘关系较近的马鞭草科（Verbenacea）作为外类群，采用NJ(neighbor joining)，MP(maximum parsimony)，BI(Bayesian inference)构建系统发生树。结果表明：紫草科平均遗传距离0.0159，属内平均遗传距离0.004，属间平均遗传距离0.014，属内属间差异显著（p=0.0180.05），外类群与紫草科植物间的平均遗传距离为0.057；构建3种系统发生树有较高的一致性；紫草科为单系类群，共聚为4个分支，勿忘草属（Myosotis L.）和软紫草属（Arnebia Forsk）各聚为一支，蓝蓟狼紫草属、拟紫草属聚为一支，肺草属与鹤虱属（Lappula V. Wolf）聚为一支。以上研究结果证明rbcL基因片段能够有效鉴别勿忘草属和软紫草属，而对蓝蓟属、狼紫草属及拟紫草属的物种区分不够显著。因此，rbcL片段需要结合其它基因片段，以建立更为科学合理的基于紫草科DNA条型码分子分类体系。 基于matK序列的桃属植物系统发生研究 姜凤琴 潘伯荣 刘 斌 中科院新疆生态与地理研究所系统基因组学研究中心 ，乌鲁木齐，830011 扁桃(Amygdalus communis L.)作为桃属植物代表种，是古中亚第三纪落叶林孑遗物种，属于古地中海植物区系，具有重要的研究和经济价值。扁桃的起源尚无定论，且分属关系一直存在争议。为了研究桃属植物在蔷薇科内的进化及其系统发生关系，本研究对新疆桃属7个物种叶绿体的matK基因的部分序列测序，与GenBank中的桃亚科(Amygdaloideae)、绣线菊亚科(Spiraeoideae)、苹果亚科(Maloideae)和蔷薇亚科(Rosoideae)叶绿体基因组的matK基因条形码序列进行比对并构建了系统发生树。结果表明：MP、ML、NJ树结果基本一致，明显分为3大分支。苹果亚科与蔷薇亚科各形成一个分支，而绣线菊亚科与桃亚科聚为另一大分支，说明桃属植物与绣线菊亚科关系较近，且李亚科的印第安属植物Oemleria cerasiformis固很可能支持将李属分属于绣线菊亚科的观点。野生扁桃聚为一小分支，栽培扁桃聚在一小分支，除榆叶梅外其它桃属植物聚为一小分支，而在中国植物志中被分在桃属植物的重瓣榆叶梅与单瓣榆叶梅并未与其它桃属植物聚在一起，固其分类还有待于进一步研究与分析亲。本文为以matK基因序列对新疆扁桃植物以及桃属植物的分属问题提供了分子依据。 新疆野生郁金香和荷兰栽培种具有不同的进化途径 梁雪1 李岩1 巴雅尔塔1,3 赵玉3 王健4 祝建波5 阎平5 刘斌1,2 1.中科院新疆生态与地理研究所系统基因组学研究中心，乌鲁木齐，830011 2.中科院荒漠生态与生物资源重点实验室，乌鲁木齐，830011 3.伊犁师范学院，伊宁，835000 4.阿勒泰地区林业科学研究所，阿勒泰，836500 5.石河子大学生命科学学院，石河子，832000 郁金香(Tulipa L.)的起源地至今仍是一个存在争议的问题。有些学者认为是伊朗或土耳其，但有些人对此提出了异议，认为新疆包括中亚地区也应该是其起源地之一。本研究运用DNA条形码技术研究新疆野生郁金香与荷兰引进种的亲缘关系和系统分类。利用rbcL和matK基因条形码的通用引物对采自新疆北疆地区野生郁金香和荷兰引进栽培种进行PCR扩增。基于rbcL和 matK两个目的片段，利用最大简约法(Maximum Parsimony)和最大似然法（Maximum Likelihood)构建的系统发生树拓扑结构基本一致。结果显示：所有郁金香构成一个单系类群。新疆野生郁金香和荷兰引进栽培种总体聚为三大分支，其中野生种的一个分支与栽培种的另外两个分支为姐妹群关系。利用MEGA软件来计算种与种之间的遗传距离表明野生种之间有较近的亲缘关系，栽培种的两个分支间具有一定的遗传距离，但两个分支内部的亲缘关系较为接近，具有较高的支持率。通过本研究，我们为栽培郁金香和新疆野生郁金香确立了国际通用的植物基因条形码，对野生郁金香进行了有效的分类并首次提供分子证