基于液相芯片技术的呼吸道病原体多重检测技术的建立.pdfVIP

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基于液相芯片技术的呼吸道病原体多重检测技术的建立.pdf

· 72· MedicalLaboratoryScienceandClinics,2014,Vo125,No.3 医学检验与临床 2014年第 25卷第3期 基于液相芯片技术的呼吸道病原体 多重检测技术的建立 袁勤芬 。 尹飞飞 王华林 刘万红 1(武汉大学基础医学院,湖北武汉,430071) 2(中国科学院武汉病毒研究所,湖北武汉,430071) 呼吸道感染是临床最常见 的疾病之一,可由多 1.1材料与试剂 种病原体引起,包括细菌、病毒、支原体、衣原体 1.1.1病毒与细胞株 等,其临床表现与治疗因病原体不同而存在较大差异 选取常见多发的呼吸道合胞体病毒 (RSV)、流感 (I-4) 。 研究表明95%的急性上呼吸道疾病和大部分的 病毒A型 (INFA)、流感病毒B型 (INFB)和副流感 下呼吸道疾病均由细菌外的病原感染引起,其中以呼 病毒 (PIV)等作为检测对象。所有阳性对照病毒和 吸道病毒最为常见,包括呼吸道合胞体病毒 (respiratory veto、MDCK等宿主细胞株均由本实验室保存。 syncytialvirus,RSV)、腺病毒 (adenovirus,ADV)、流感 1.1.2试剂与仪器 病毒 A型 (InfluenzavirusA,INFA)、流感病毒 B型 病毒RNA提取试剂盒、一步法RT—PCR试剂盒 (InfluenzavirusB,INFB)、副流感病毒 fparainfluenza 购 自Qiagen公司、链合青霉素标记的藻红蛋白(SAPE) virus,PIV)等 一。大部分呼吸道病毒具有感染力强、 购 自Millipore公司,Taq酶购 自Takara公司,微球 、 传播快、潜伏期短、发病急等特点,并且新致病性病 luminex检测仪购 自luminex公司。 毒还在不断被发现。据统计,呼吸道和胞病毒、甲型 1.1.3检测标本 流感 、乙型流感和副流感病毒是呼吸道病毒感染中最 l4份医院来源疑似呼吸道病毒感染咽拭子由本室 常见的病原体,占病毒感染种类的90%,致死率8% 收集和一80~C冻存。 左右,严重危害到公众的健康和安全 (7)。因此,建立 1.2方法 一 种快速准确的诊断方法 ,不仅有利于病因确诊 ,也 1.2.1寡聚核苷酸探针的设计与合成 有利于临床采取针对性治疗 ,同时在病毒的流行病学 根据GENEBANK中呼吸道合胞病毒、流感病毒 调查以及阻止病毒的传播与扩散中具有重要的作用。 A型和B型以及三种亚型的副流感病毒核酸序列,利 扩增子拯救多重PCR检测技术是近年来发展起来 用Bioedite、primer等生物学软件对核酸序列进行比对 的一种崭新的扩增策略,即利用两步反应同时对多个 后,针对保守区域进行PCR引物和探针的设计 ,其中 靶点进行扩增 :第一步反应采用巢式基因特异性引物 上下游引物的5’端加入不同的通用接头序列 (5’一 富集核苷酸,并把标签引人扩增产物 ;随后采用生物 通用序列一病原体特异性序列 一3’)用于第二轮PCR。 素标记的通用引物对带有标签的产物进行 PCR扩增和 所有引物和探针均由Invitrogen公司合成。引物和探针 标记 ;最后利用 Luminex多重液相悬浮平台检测得到 序列结果如表 1所示。 的产物。本文中,我们选取了呼吸道疾病中主要的四 1.2.2病毒培养和核酸提取 种病毒作为检测 目标,采取扩增子拯救多重PCR扩增 呼吸道合胞体病毒感染 vero,流感病毒A型、流 技术,结合LuminexxMAP检测平台,构建了一

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