蛋白质能带结构的晶体轨道法研究_金属离子和水对蛋白质能带结构的影响.pdfVIP

第 卷 第 期 生 物 物 理 学 报 年 月 蛋 白质能带结构的晶体轨道法研究 金属离子和水对蛋 白质能带结构 的影 响 肖奕带 陈润 生 倪 向善 为 国科 学 院生物物研 究所 北 京 摘 要 木文 用 晶休轨道方法研 究 了金属离子和 水对蛋 白质能带结构 的影 响 结果能 带 变 化 的程度与金 属离子或水结合 的部位有关 在某些结合部位 , 价带宽和 或 禁带宽发生 了很 大的变化 , 在 前两 部份 中 川 ’ 我们 研 究 了蛋 白质 中不 同氨基酸残基侧链和 蛋 白质构象 的变 化对 。 其能带结构 的影 响 , 考虑 的是 蛋 白质分子 自身 的变化 在生物体 中, 蛋 白质分子 处于 细胞 内。 细胞 中含有大量 的水 和 一些离子 , 如 , 十 等等 。 水和离子 与蛋 白质分子 的相 互作 用将会影 响后者 的能带结构 。 本 文将研 究水和 离子对 蛋 白质能带结构 的影 响 。 在这里 , 我们 只研 究金属离子 和水 与欣平 面上 的原子 的相 互作用 , 而不考虑 与侧 十 链 原子 的相 互作用 , 并且 只研 究 离子 和水 结合 到肤平面上不 同原子对蛋 白质能带 结构 的影 响, 我们计算 了四 个模 型 , 其 中两 种是 。十 离子 与 作用 的复合体 , 两种 是 水和 作用 的复合体 。 方 法 在计算 中, 我们采 用 了最近邻 晶胞相互作用近似下 的 晶 体轨道 法 。 法 的详细说 明见第一部分 川 。 计算所用 的计算机程序是 我 们 自 己 编 写 的。 。 在计算 中每个 晶胞 中包括一个甘氮酸残基和一个 。 离子 或水分子 的原 。 十 。 子坐标取 自 ‘ 的文 章 离子和水分子 与甘氮酸残基 的相 对位置 图 是 参考 · 计算结果 ‘, ‘, 根据能量 极小选取 的。 现在 武汉 市华 中工 学 院工作