虾夷扇贝(Mizuhopecten+yessoensis)均一化cDNA文库的构建和ESTs分析.pdfVIP

虾夷扇贝(Mizuhopecten 构建及ESTs分析 孟祥盈常亚青仇雪梅王秀利牛 大连海洋大学生命科学与技术学院大连l16023 ·为通讯作者，E—mail：xiuliwan9417@sina．corn 摘要：本研究构建了虾夷扇贝闭壳肌均一化cDNA文库，共得到4595条高质量的表达序 tags，ESTs)。通过聚类组装这些ESTs，得到平均长度为544 列标签(Expressedsequence bp (Clustersof Orthologous unigene在COG中被检索注释。通 unigene．这些序列包含了727种蛋白质结构域；有460 过对这3种不同比对结果的比较，共有1646 个unigene进行Gene 细胞过程，分子过程)被注释。其中与“生物过程”相关的有577个，与“分子功能”有关的有 801个，与“细胞组分”有关的有334个。在“生物过程”这个体系中，大部分基因与“生理过程 (physiological 和87％。在“分子功能”体系中，63％的基因与“抗氧化剂活性(antioxidantactivity)”相关， 其次是“催化活性(catalyticactivity)”，占到46％。在“细胞组分”体系中，90％基因被分到“细 (macromolecular of complex)”类。根据京都基因和基因组百科全书(KyotoEncyclopedia Genesand Genomes，KEGG)的注释分析，有345 unigene被归于103种代谢通路中。在这 acid metabolism)”和“能量代 到“氨基酸代谢(amino metabolism)”、“糖代谢(carbohydrate families)” 谢(energymetabolism)”这三个亚类中。在其他的大类中，“蛋白质家族(protein information 占21．7％，“遗传信息加工(genetic processes)占11．6”： 238 被分成4大类：“折叠，排序，降解”、“复制与修复”、“转录”和“翻译”。根据Blastx注释结 果，得到49种免疫相关基因。这些免疫相关基因被分成5大类：免疫识别、应激基因、蛋 白酶和蛋白酶抑制因子、细胞信号转导因子和其他基因。这些免疫相关基因可以为我们提供 贝类在抵抗疾病和受到环境压力时进行免疫反应的重要信息。综上，本研究可以为贝类的遗 传学研究提供一些基础信息。 关键词：虾夷扇贝；闭壳肌；eDNA文库；表达序列标签 239