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·146· 第二部分 分子系统学、进化与资源评价
黄牛、牦牛和水牛MyoG基因多态性及其遗传分化
王敏强1,苏培1,刘晓玲1,武拴虎2,张志强3
(1.烟台大学生命科学学院,山东烟台264005;2.烟台大学计算机学院,山东烟台264005;
3.滨州市畜牧兽医局,山东滨州256618)
引育
究表明MyoG与生长速度、产肉率以及出生体重等重要经济性状存在相关性,但尚无基于不同牛种MyoG研究遗传
分化的报道。本研究利用特异性引物扩增黄牛、牦牛和水牛的MyoG基因exon1及5’端部分序列,为进一步探讨
我国3个主要家养牛种的遗传分化及牛属动物科学分类提供部分试验依据。
材料与方法
设计的特异性引物扩增MyoG基因的外显子1和5’端部分序列,PCR产物送上海生工生物工程技术服务有限公司进行
正反向测序,测得序列用DN^M^N(6.0.3.48)、ClustalX(1.83)、DnaSP500.07进行核苷酸多态性分析,用Mega4.1邻接
法(Neighbor-Joinirlg.NJ)构建分子系统树。
结果
对4个牛群体23条核苷酸序列比对分析显示,LX牛所测6条序列中有2条在同一位置g.48发生(、厂.C突变,BH
1
牛和YK(各6条)序列中没有任何突变发生;GX水牛序列共发生6处突变,其中5处发生在全部所测5条序列exorl
究的GX水牛并未与同种水牛(Bubalusbubalis)聚为1支,而是独为1支。
讨论与结论
核苷酸序列比对结果表明,4个群体DNA多态性较低。在LX牛检测到1个多态位点,BH牛和YK群体中未发现
多态位点。虽然GX水牛群体中发现6个突变位点,但群体内只有1个多态位点和1种单倍型。核苷酸变异类型分析发
现,存在转换和颠换两种类型,没有缺失/插入。外显子内的6个核菅酸替换均发生在编码三联体/密码子的第三位,均为
同义替换,符合分子进化的中性学说。对外显子编码部分氨基酸序列比对分析发现,4个群体间同源性达10006。进一步
说明该基因在黄牛、牦牛和水牛不同种群中的十分保守。但在核苷酸变异层次上,水牛遗传分化明显。
近年来我国学者基于线粒体基因和核基因对牦牛的属级分类地位进行了探讨,尚未形成一致观点,有的认为应将
牦牛划分为牛亚科中1个独立属——即牦牛属,有的则认为应将牦牛列为牛属(Bos)中的1个亚属或1个种。本研究发
现,牦牛MyoG部分序列与黄牛完全一致,在系统进化树中,YK也同LX牛和BH牛以及犏牛、瘤牛、大额牛、和GX水
牛聚为一大支。在染色体组层次,牦牛与黄牛同为2n=60,二者之间杂交可育(犏牛).据此,支持将牦牛归为牛属(Bos)中
1个亚属或1个种的观点。GX水牛核苷酸序列片段突变位点较多。与黄牛和牦牛群体的核苷酸序列歧义度(Oxy)最大,
这与国内诸多学者报道的黄牛与瘤牛关系最近,二者与牦牛的关系较近,与水牛关系最远的结论吻合。GX水牛与并未
与同种水牛聚为一支的原因尚需扩大样大作进一步研究。本研究对明确中国牛亚科动物分类地位与遗传资源保护和利
用有一定的指导意义。
关键词:黄牛;水牛;牦牛;MyoG,DNA多态性;遗传分化
致谢:本研究得到山东省自然科学基金资助,被烟台大学学报(自然科学与工程版)接收。
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