分析16SrRNA基因部分序列鉴定一株乳酸菌.pdfVIP

维普资讯 第 42卷 第 3期 哈尔滨医科大学学报 Vo1．42．No．3 20O8年6月 JOURNALOFHARBINMEDICAL UNIVERSITY Jun．，2008 265 分析 16SrRNA基因部分序列鉴定一株乳酸菌 付晓艳 (哈尔滨医科大学地方病控制中心 大骨节病研究所，黑龙江 哈尔滨 150081) [摘要] 目的 利用聚类分析 16SrRNA基因部分序列的方法对乳酸菌进行鉴定。方法 在表型鉴定的基础上，应 用已发表的 16SrRNA基因序列设计引物 ，扩增 L． ．L5菌株 16SrRNA基因，并进行测序，将结果与同属及非 同属 的乳酸菌进行同源性比较。结果 L．sp．L5菌株与同属的乳酸乳球菌同源性为85．5％以上，尤其与乳酸乳球菌叶 蝉亚种 NCDO2181T同源性为 99．5％，与不同属的肉明串珠菌、漫游球菌、嗜盐四联球菌同源性分别为77．5％、 82．8％、79．0％。结论 菌株 L． ．L5为乳酸乳球菌。 [关键词] 乳酸菌；16SrRNA基因；鉴定 [中图分类号]O939．117 [文献标识码]A [文章编号]1000—1905(2008)03—0265—03 Analyzeapartof16S rRNA genesequencetoidentifyastrainofLactobacillus FUXiao—yan (InstituteofKaschin-BeckDisease，CenterforEndemicDsieaseControl， HarbinMedcialUniversity，Harbin150081，China) Abstract：Objective ToidentifyastrainofLactobacillusbyusingapartof16SrRNAgenesequenceand clusterna alysis．M ethods Thegeneof16SrRNA from thestrainofL．sp．15 wasamplified thhteprimers designed byhtereportde 16SrRNA sequence．The16SrRNA seuqenceofL．sp．15 Was compared thother strainsoflacticacidbacteria．Results Th ehomologyofL．sp．15 thL．1actisWas above85．5％ ．butlower htna 82．8％ thLeuconostoccarnosu．Vagococcusfessas orTetragenococcushalophilus．Conclusion L．sp． I5 maybeastrainofL．1actsi． Keywords：Lactobacillus；16SrRNA gene；identification 早在上世纪60年代末，有科学家开始采用寡核 种群多样性的评估等领域，是一种客观和可信度较 苷酸编 目法对生物进行分类，他们通过比较各类生 高的分类方法 J。 物细胞的核糖体 RNA(rRNA)特征序列，认为 16S 利用 16SrRNA基因的这一特点，对从牛乳 中分 rRNA及其类似的rRNA基因序列作为生物系统发 离的一株细菌进行分析。该菌株细胞呈卵圆形，单 育指标最为合适 。细菌的 16SrRNA基因具有高度 生、成对或成链状，与过氧化氢酶反应呈阴性。革兰 的保守性，不同种间细菌 16SrRNA基因的同源性可