基于线粒体COI基因双翅目昆虫研究进展.pdfVIP

品多分其学拓 V01．32，Suppl． 王BntoInot目D【onoIIlia Au鲫，20lO 基于线粒体CoI基因的双翅目 昆虫研究进展 池宇，王诗迪，张春田① (沈阳师范大学辽宁省生物进化和生物多样性重点实验室，辽宁沈阳l10034) 摘要：综述了线粒体COI基因进化特点，其在双翅目长角亚目蚊总科、摇蚊总 科，短角亚目食虫虻总科、食蚜蝇总科、蝇总科、狂蝇总科、虱蝇总科、缟蝇 总科、实蝇总科昆虫的物种鉴定、系统发育和进化研究中的作用，以及在农、 林、牧业和法医学中的应用。 关键词：双翅目：COI基因：DNA分类；系统发育；进化 中图分类号：Q969．44文献标识码：A 文章编号：lOOO．7482(20lO)S0．0071．07 1引言 COI基因是线粒体基因编码的3种细胞色素氧化酶亚基之一，它是其中分子量 有变异多、易被通用引物扩增、序列本身又很少存在插入和缺失等特点(王鑫，黄 2003)：而DNA分类时所用的序列也可以用于物种的系统发育关系和分子进化的研 究。本文基于线粒体COI基因综述了双翅目昆虫的研究进展。 2 COI基因及其特点 线粒体DNA是1个封闭的环状双链，它是由13个编码蛋白质的基因、2个 C氧化酶亚基I(COI)位于线粒体基因组上，在13个编码蛋白质基因中，包括了3 种编码细胞色素氧化酶亚基的基因，COI基因就是其中分子量最大、功能结构域最 为保守的基因。mtDNA是独立于核DNA之外的遗传基因，具有结构简单、序列 和组成保守、易于操作、母系遗传、无重组、单拷贝等特点，同时它的分子量相对 种系统发育关系的研究中经常被用作分子标记。在以前的系统发育关系的研究中， 收稿日期：20lO．04．19 ①通讯作者，E-mail：chuntianzhang@yahoo．cn 7l 昆虫分类学报 第32卷增刊 12S rDNA和16SrDNA比较保守，可以区分属、种团和分化时间较早的种： COII、NDl和ND5则是进化比较快的基因，用来区分亲缘关系比较密切的种、亚 种及地理种群(王备新，杨莲芳，2002)。而COI基因由于其氨基酸的演化速率较 慢可以区分分异时间较远的种类，同属物种的COI基因序列又存在有足够的变异能 够区分亲缘关系很近的种类，所以它被广泛应用于不同分类阶元层次上的分子系统 学研究(付景，张迎春，2006)。不仅如此，COI基因在保证足够变异的同时很容易 被通用引物扩增，能够获得绝大多数动物的5’端序列，其序列又很少有插入或缺 2008)。DNA条形码(DNA 为编码基础，使DNA序列作为生物分类的重要依据之一。 3基于线粒体COI基因的DNA分类原理 在生物分类中，以DNA序列作为生物物种识别的方法最初应用于病毒、细菌 和原生动物类群的研究中，后来这种方法广泛应用于物种多样性的调查研究中，并 积累了大量的数据和文献。2003年，DNA条形码概念首次提出：鉴定物种就如同 使用商品uPC条形码，使用扫描仪就能识别。因为COI基因的通用引物可以很容 易获得绝大多数动物的5’端序列，加拿大圭尔夫大学的学者提出利用COI的特定 4种可能，45 Herbert，2003)。理论上，DNA序列上的每个位点都有A、T、G、C 个碱基的序列就可以区分开近lO亿个物种，这远远超过现存物种的总数，即使由 于自然选择的原因，某些位点已经被固定，导致组合数减少一些，但是现代分子技 术可以很容易的扩增出几百个碱基的序列，足够区分所有的物种(肖金花等， 为DNA条形编码可以形成物种识别系统，所包含一定的系统发育信息对分子系统 学研究有很大帮助。DNA分类解决了传统分类的很多弊端，比如对有些寄生物和 昆虫幼虫等无法用形态特征描述的物种，发现由于形态趋同而未被发现的隐存种， 类、鱼类、实蝇、蚊虫及入侵