丹参海藻糖-6-磷酸合成酶基因(SmTPS)的克隆及其表达分析.pdfVIP

丹参海藻糖-6-磷酸合成酶基因(SmTPS)的克隆及其表达分析.pdf

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丹参海藻糖-6-磷酸合成酶基因(SmTPS)的克隆及其表达分析.pdf

基因组学与应用生物学,2014年,第33卷,第2期,第357—364页 GenomicsandAppliedBiology,2014,Vo1.33,No.2,357—364 研究报告 ResearchReport 丹参海藻糖 一6一磷酸合成酶基因(SmTPS)的克隆及其表达分析 岳思思 姚伟 王东浩 陈玉芹 王拮之 药用资源与天然药物化学教育部重点实验室,西北濒危药材资源开发国家工程实验室,陕西师范大学生命科学学院,西安,710062 通讯作者,zzwang@snnu.edu.cn 摘 要 对丹参 EST序列进行Blast分析,得到一条海藻糖 一6一磷酸合成酶(TPS)基因,将其命名为 SmTPS, GenBank注册号为 JF937196。该基因 eDNA全长 2836bp,包含一个长为 2574bp的ORF,编码 857个氨基 酸 。生物信息学分析表 明,分子量为 97.04kD,等电点为 5.76,含 仅一螺旋、B转角、延伸连和无规则卷 曲。该蛋 白同时具有海藻糖 一6一磷酸合成酶(TPS)~D海藻糖 一6一磷酸磷酸酯酶(TPP)的功能结构域。系统进化树分析 表明丹参TPS功能域和拟南芥AtTPS6属于一类,而 TPP功能域与低等生物酵母 ScTPS2属于一类。实时定 量 PCR结果分析表明,SmTPS基因在丹参不同组织器官中差异表达,其茎中表达量最高。在干旱和低温处理 下,其表达量与对照相比均可上调约2倍,表明SmTPS基因在丹参抵抗干旱和低温胁迫中发挥一定的作用。 关键词 丹参,海藻糖,基因克隆,表达分析 CloningandExpressionAnalysisofTrehalose一6一PSynthaseGene(SmTPS) inSalviamiltiorrhizaBunge YueSisi YaoWei W angDonghao ChenYuqin W angZhezhi KeyLaboratoryoftheMinistry ofEducation forMedicinalResourcesandNaturalPharmaceuticalChemistry,NationalEngineeringLaboratory f0r ResourceDevelopmentofEndangeredCrudeDrugsinNorthwestofChina,ShaanxiNomr alUniversity,Xi’an710062 Correspondingauthor,zzwnag@snnueducn DOI:10.13417/j.gab.033.000357 Abstract ByanalyzingEST sequencesofSalviamiltiorrhiza,anew genewhich showedhighsimilaritywith trehalose一6一Psynthase(TPS)wasclonedandnamedasSm豫 (GenBankaccessionnumber:JF937l96).Theful1. 1engthcDNA sequenceof5m7 is2836bp long,whichincludesa2574bpopeningreadingflame , encodesa 857一amino-acid protein.Bioinformaticsanalysisshowed thatmolecularweightofcycloartenolsynthase iS 97.O4kD,theoryisoelectricpointis5.76,includingalphahelix,betatum extendstrandandrandom coil.Amino , acidsequenceshowedthatufnctiona1structuredomainsoftrehalose一6一Psynthase(TPS)andtrehalose6一Pphos— phatasewerepresentinSm .wepresentphylogeneticanalysesofthetrehalose一6一phosphatesynthase(TPS) andtrehalose—phosphatase(TPP)domainsandshowthatSm

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