化学信息学和生物信息学开放性比较.pdfVIP

化学信息学和生物信息学开放性比较.pdf

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第 卷 第 期 化 学 进 展 7: Y0+ 3 7: I0 3 年 月 , !% =9S=TUU RI CVTWRU;=X @NH 3 !% 化学信息学与生物信息学开放性比较 ! 乔园园 鹿 涛 车云霞 (南开大学化学学院 天津 6% 7) 摘 要 通过对化学信息学与生物信息学在公共资源、数据文件格式、软件编程语言、科学文献与教材 等诸方面的比较与分析,指出生物信息学的成功因素在于其开放性;与之相比,虽然高等学校、研究所等教育 科研领域和商业公司(特别是药物研发公司)都发布了不少化学信息学开源或自由软件以及一些开放数据, 但化学信息学仍然由于各种原因使得开放性不足。有鉴于此,国内建立了化学化工资源导航系统,启动了 《计算化学’85*.5 研究及示范应用》等国家自然科学基金重大项目。在教育、教学方面也应继续改革,使化 学信息学能真正适应和促进当前药物发现研究。 关键词 化学信息学 生物信息学 开放性 药物发现 中图分类号: ; ; 文献标识码: 文章编号: ( ) 9#’6: ;677 =:7 ? ! @ 7$’!A7B !% ’#!’: !#$%’() * +$,)),(( -,./,,) !0,#’)*#%.’1( %)2 -’’)*#%.’1( !#$ %#’(#’ ! ) *#$ +,- %’.# ( , , , ) C0++D 0E CF(*8GH, I).2)* J.*KH8*G, ;*).L*. 6% 7 CF*.) 34(.%1. M, GF 50(N)H*80.8 OGP. 5F(0*.E0H()G*58 ).4 O*0*.E0H()G*58 0. 8-5F )8N5G8 )8 N-O+*5 H80-H58 , 4)G) E0H()G8 ,NH0DH)((*.D +).D-)D ,+*GH)G-H8 ).4 GQGO0028 ,*G *8 5+)H GF)G ,0N..88 *8 GF 8-5588 E0H , O*0*.E0H()G*58 O-G *G *8 GF 8F0HG.88 E0H 5F(0*.E0H()G*58 GF0-DF +)-.5F4 )H+*H 3 M8*48 ) .-(OH 0E 0N. 80-H58 0H EH )NN+*5)G*0.8 ).4 0N. 4)G)O)88 E0H 5F(0*.E0H()G*58 EH0( )5)4(*) ).4 *.4-8GH, , GFH *8 8G*++ ) F-D D)N -.E*++4 3 , R. )44*G*0. GF HE0H()G*0. *. G)5F*.D 8,8G( 8F0-+4 O 50.G*.-4 *. 0H4H G0 5)G5F -N P*GF GF H)N*4 N)58 0E 4H-D 4*850KH, H8)H5F8 3 ; ; ; 5,6 /2( 5F(0*.E0H(

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