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蛋白质组学在药物研究中的应用.pdf

·988· Bulletin2009 中国药理学通报ChinesePharma贮ologicul Aug;25(8):988—9l 蛋白质组学在药物研究中的应用 赵欣2,蒲小平1’2 (北京大学1.天然药物及仿生药物国家重点实验室、2.药学院分子与细胞药理学系,北京100191) 91 中国图书分类号:R-05;R394.3;R9;R 养细胞或各种细胞系)、组织(如肝脏、脑、肾等)、体液(如血 文献标识码:A文章编号:100l一1978(2009)08—0988—04 清、脑脊液、尿液)等。实验设计通常包含3组样品:正常对 摘要:近年来,蛋白质组学技术飞速发展,尤其在药物的靶点 照样品、疾病模型样品以及药物处置样品。疾病模型不论细 确认、药物作用机制等研究中,发挥出了其极大的技术优势, 胞模型还是整体动物模型,都应该选择与临床疾病病理生理 明显地提高了药物发现的效率。该文对蛋白质组学的基本 和发病机制相近或类似的模型。将这些样品根据需要制备 方法、新技术以及它在药物靶点的发现和确认、阐明药物作 总蛋白、膜蛋白、核蛋白或是富集糖蛋白等,然后,通过除盐、 用机制、药物毒理学、耐药相关机制研究、临床医药研究等方 除核酸或去除白蛋白等处理减少对电泳有干扰的物质。在 面的应用进行综述。 同样条件下制备和处理后的蛋白质样品在同样条件下通过 一维电泳或二维电泳(two-dimensionalgel 关键词:蛋白质;蛋白质组学;新技术药物;靶点;临床研究 DE)进行分离胆J。 随着科学技术的发展,生命科学研究进入了后基因组时 代,研究者们越来越意识到,仅仅完成基因组的测序并不足 以阐明生物的功能,研究重点逐渐由获取基因序列信息转向 研究基因的功能。蛋白质是生物功能的主要体现者,它通过 其自身特有的活动,例如修饰加工、转运定位、结构变化、蛋 白质与蛋白质的相互作用、蛋白质与其它生物分子的相互作 用等,控制和调节着诸多的生命活动。蛋白质组是指某一物 种、个体、器官、组织或者细胞基因组的全部蛋白质产物的表 达谱,或称一种细胞内存在的全部蛋白质。蛋白质组学 (proteomies)是指研究蛋白质组的科学…,本质上是在大规 模水平上研究蛋白质的特征,包括蛋白质的表达水平、翻译 后的修饰、蛋白与蛋白相互作用等,由此获得蛋白质水平上 的关于疾病发生,细胞代谢等过程的整体而全面的认识。近 年来,蛋白质组学有了长足的发展,技术已经趋于成熟,并广 泛应用于各个领域,其中在药物的靶点确认、药物作用机制 研究等方面发挥出了其极大的技术优势,明显提高了药物发 现的效率。近10年来,国内外发表的相关论文已达3千余 篇。 蛋白质组学技术已经应用于药物研究的各个阶段,其技 术路线如Fig1所示。 电泳后对凝胶进行染色,常用的方法如考马斯亮蓝染 1基本方法及其新技术 色、硝酸银染色、银蓝染色p1和荧光染色。银蓝染色是一种 1.1基本方法最经典的技术路线为电泳技术和质谱技术 改进的考马斯亮蓝染色方法,灵敏度明显高于普通考马斯亮 的联用。这种方法适用于大多数样本,包括细胞(如原代培 蓝染色,而比硝酸银染色法低,但操作要求不高,染色条件亦 容易控制,成本相对较低,质谱兼容性好,它的应用越来越广 收稿13期:2009—04一02,修回日期:2009—06—24 泛。 基金项目:国家重点基础研究发展计划(973计划)资助项目(No

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