基于ND4香鱼群体遗传分析.docVIP

基于ND4基因的香鱼群体遗传分析 1前言 香鱼（Plecoglossusaltivelis）隶属胡瓜鱼目(Osmeriformes)香鱼科(Plecoglossidae)香鱼属。分布于西北太平洋沿岸，南至？，北至？，为东亚特有鱼种；分布于日本的香鱼被划分为指名亚种(P.altivelisaltivelis)和琉球亚种(P.altivelisryukyuensis，仅分布于琉球群岛)（Nishida(1985，1986，1988)）；Shan等(2005)认为中国大陆沿海洄游型香鱼应独立为为“中华香鱼亚种”(P.altivelischinensis)。 香鱼肉质细嫩，清香无腥，为水中珍品，具有较高的经济价值。近年来，由于环境污染、酷渔滥捕、水利建设等因素的影响，野生香鱼资源严重衰退，甚至绝迹(牟秀林，1994；谢起浪等，2003；陈志俭，2003)。野生香鱼资源亟需进行合理保护，并进一步开发利用。关于香鱼生活习性，生理生态，养殖技术等研究常见于报道(李思忠，1988；李明云等，1999，2004；杨翠平，2007)，中国沿海各地近年也开始大规模养殖和人工放流香鱼(叶启旺，2003)。 群体遗传结构及遗传多样性能反映出群体种质资源情况，是合理制定群体保护策略和种质资源开发方案的前提条件。动物线粒体基因组具有结构简单，进化速度快，严格母系遗传等特点，被广泛用于进行群体遗传结构分析。ND4基因是编码线粒体电子传递链复合体组分NADH氧化还原酶第4亚基的基因，在动物线粒体编码基因中进化较快，多态性较为丰富，适于分析亲缘关系较近群体的系统发育关系和群体的遗传结构(Liuetal.1999；Nearetal.2003)。，Takeshima等(2005)也指出在香鱼遗传结构及分类地位上，ND4基因序列比控制区更能准确反映香鱼两亚种间真实的进化关系。 国内外许多科学家采用不同分子生物学手段对不同地区、不同类型（洄游型和陆封型）的香鱼进行过相关研究，但分析对象仅限局部地区（）。 本为分析中国沿海6水域香鱼线粒体ND4基因，并与日本3香鱼群体进行比较，一方面确定中国沿海香鱼的分类地位，另一方面揭示中国沿海香鱼的遗传多样性、遗传结构和种群历史动态，以其为野生香鱼资源的保护和种质资源利用提供背景资料。 2材料与方法 2.1实验材料 采集于07年9月至09年10月之间7个群体116尾香鱼，采集地点及其他详细信息参见表1和图3，其中除青岛群体为子二代养殖群体外，其余皆为野生群体。采样时，将确定来源的新鲜野生香鱼洗净后放入95%的酒精中，详细记录采样地点、采样时间及条数，以备后续试验之用。 表1：中国7个香鱼群体采集地、样本数及样品编号 Table1：Samplinglocalities，sampleNo.in7ayupopulationsinChina 采集地点 Location 经度 Longitude(°E) 纬度 Latitude(°N) 样品编号 Sample 辽宁丹东 124°23′ 40°08′ DD1~17 山东青岛 121°00′ 37°09′ QD1~15 *福建东张水库 119°15′ 25°43′ *DZ1~18 广东饶平 117°00′ 23°39′ RP1~9 广东海丰 115°04′ 22°52′ HF1~17 广西东兴 107°58′ 21°33′ DX1~18 注：*表示为陆封型香鱼群体。 Note:*lacustrine. 表2：本文使用的日本香鱼基因序列来源 Table2：SequencesinformationofJapaneseAyuusedatpresentstudy 分类地位 采样地点 Localities 地点简写 Abbreviation ofLocalities 样本数 Samplesize GenBank登录号 GenBankAccessionNo. 日本香鱼指名亚种 P.altivelisaltivelis *AdoRiver *ADO 10 AB181768 ∣ AB181777 AmoriRiver AMR 11 AB181757 ∣ AB181767 ChikugoRiver CKG 12 AB181745 ∣ AB181756 SameRiver SAM 13 AB181732 ∣ AB181744 日本香鱼琉球亚种P.altivelisyukyuensis YakugachiRiver YKG 10 AB181790 ∣ AB181799 KawauchiRiver KWU 12 AB181778 ∣ AB181789 图3：香鱼采样地点的地理分布示意图(参考Jamandre等，2009) Fig3:Thegeogr