菜花DNA的提取.pptVIP

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菜花DNA的提取.ppt

一.实验原理 1.核酸分离提取的原则 1)应保证核酸一级结构的完整性 2)排除其他分子的污染 A. 核酸样品中不应存在对其有抑制作用的有机溶 剂和过高浓度的金属离子 B.其他生物大分子如:蛋白质,多糖和脂类分子 的污染应降低到最低程度 排除其他核酸分子的污染(如:提取DNA分子 应除去RNA;反之亦然) 2. 核酸提取的步骤 1)破碎细胞(材料不同,方法不同) 匀浆器,捣碎器,溶菌酶消化,碱裂解等。 2) 除杂质,提DNA 杂质:蛋白,多糖,脂类,RNA ,DNase A. DNase的抑制 DNase需Mg2+,Ca2+激活,所以提取时加0.01M EDTA或EDTA钠盐。(螯合金属离子) 加去垢剂或变性剂(SDS),可使DNase变性失活 B.? 除RNA 酶法:加RNase 调节pH:RNA能在室温条件下被稀碱水解成核甘酸而DNA对碱较稳定(核酸的理化性质),所以提DNA一般要在偏碱的环境中提取,提RNA要在偏酸的环境中稳定。 调节盐浓度(盐的分步沉淀):在浓NaCl(1-2M)溶液中,DNA溶解度大,RNA溶解度小;在稀NaCl(0.14M)中,DNA溶解度小,RNA溶解度大,因此可利用不同浓度的NaCl溶液将DNA和RNA从样品中分开。 C. 除蛋白 加去垢剂或变性剂(SDS,十二烷基硫酸锂LDS,十二烷基肌酸钠,脱氧胆酸钠)使蛋白变性,与DNA分开; 用有机溶剂沉淀,除去蛋白 常用的有机溶剂:苯酚,氯仿,异丙醇,醚,8-羟喹咛,间甲酚等 本次实验所用:氯仿:异戊醇=24:1 氯仿:使有机相和水相易分层,增加核酸得率,同时可除去脂类。 异戊醇:可减少泡沫,也能促使有机相,水相分离。 D. 除糖,脂类 对于含糖量高,含脂高的样品需要做 加蛋白水解酶:如提动物组织中的DNA,常加蛋白酶 K 二. 利用盐不同浓度提取DNA 1. 实验试剂和器材 1)材料 菜花 2)实验试剂 5mol/L NaCl溶液; 0.14mol/L NaCl-0.15mol/L EDTA-Na溶液; 25% SDS 溶液; 24:1 氯仿-异戊醇混合液;乙醇; 3) 实验器材 研钵 离心管:10ml指管 移液管, 高速离心机 水浴锅 三. 实验步骤 1.取菜花 4g,置研钵中,加少许石英沙仔细磨成糊状。 2.分次加入10ml 0.14mol/L NaCl-0.15mol/L EDTA溶液,将糊状物转入 两个10ml的离心管中。6000r/min离心10min,弃去上清。(注:做鸡肝的可再加7ml/管 0.14mol/L NaCl-0.15mol/L EDTA溶液,将沉淀搅匀后6000r/min离心8min,弃去上清)。所得沉淀为脱氧核糖核蛋白粗制品。 3.向上述沉淀物加入0.14mol/L NaCl-0.15mol/L EDTA溶液2ml/管,25%SDS溶液0.25ml/管,搅拌至混匀。置60℃水浴保温10min,取出冷至室温。此步操作系使核酸与蛋白质分离。 4.加入5mol/L NaCl 溶液1ml/管,搅拌混匀,加入约一倍体积的氯仿-异戊醇混合物(约4ml/管),颠倒混匀1-2min。 6000r/min离心10min。 5.吸出上清至洗净的研钵中,加入2倍体积的预冷95%乙醇,放置2-3分钟,DNA沉淀析出,用玻棒慢慢搅动,可将DNA丝状物缠在玻棒上。 6.将沉淀转入eppendorf管中,用无水乙醇洗涤一次,自然干燥,4 ℃保存备检测. 四.实验结果分析讨论 写出本次实验中提取DNA时每一步操作中所用试剂的目的。 查阅相关资料,写出至少一种其它方法提取DNA的原理及步骤 五. 琼脂糖凝胶法检测DNA 核酸检测方法 紫外吸收法 有机试剂法 琼脂糖凝胶电泳法 提取完好的DNA琼脂糖凝胶电泳图谱 未除去RNA的DNA琼脂糖凝胶电泳图谱

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