比较基因组学与人类基因组研究.pdfVIP

《生物工程进展》2000 ,Vol . 20 ,No . 1 专 　论 比较基因组学和人类基因组研究　　　　 吴学军 　柴建华 　 ( 复旦大学遗传学研究所 　上海 　200433) 摘要 　在人类基因组计划突飞猛进地开展的同时 ,模式生物基因组计划也在轰轰烈烈地进行 ,并 取得许多实质性的进展 ,是人类对于模式生物基因组有了更广泛更深刻的认识 。这些知识的积 累 ,从根本上推动了人类基因组计划的进行 。 关键词 　人类基因组 　模式生物基因组 　人类疾病基因 　　人类基因组计划与模式生物基因组计划正在平 较的结果 。虽然 Fug u r ubrip es 的内含子比较小 ,但 行地进行 。利用模式生物基因组与人类基因组之间 是它的内含子和外显子的组织结构与哺乳动物惊人 编码顺序上和组织结构上的同源性 ,克隆人类疾病 地相似 ,并且很少有与哺乳动物不同的剪切位置 。 ( ) 基因 ,揭示基因功能和疾病分子机制 ,阐明物种进化 14 　在几种模式生物都发现了重复 duplication 。 关系 ,及基因组的内在结构 ,这便是比较基因组学 。 同时存在两份或两份以上的顺序一致或十分相似的 目前与人类基因组计划同步进行的模式生物有 编码蛋白的 DNA 顺序 ,称为冗余 。它是新的功能 E . col i ,酵母 ,线虫 ,果蝇和小鼠,还有一些与人类生 进化必要的原材料 。理解冗余真正的本质是阐明基 活密切相关的哺乳动物 。酵母作为第一个真核生物 因组中基因生物功能的前提 。酵母全基因组测序的 基因组于 1996 年完成 DNA 测序 ;线虫作为第一个 结果表明 ,在进化的某些时刻发生了重复 。在酵母 多细胞生物基因组于 1998 年底完成测序 。而果蝇 , 着丝粒的周围区域和某些染色体臂的中央可以看到 小鼠和其它模式生物的基因组也以惊人的速度在进 这种重复 。在多细胞生物的基因组中 ,这种重复造 行 。大量数据的积累将使人类对于生命以及人类自 成的冗余也随处可见 。 身有崭新的认识 。 15 　在各种不同的物种中 ,绝大多数的核心生物功 能是由相当数量的 ort hologous 蛋 白承担 ,所谓 or 1 　从模式生物基因组研究中得出一些规律 t hologous 蛋白就是一些在不同物种中有共 同祖先 11 　模式生物基因组一般都比较小 ,但是编码基因 的蛋白质 。在不同的物种中这些蛋白的数量十分相 的比例较高 ,重复顺序和非编码顺序较少 , 是一些 似 ,它们主要是在生物体 中执行 中介代谢 ,DNA , “压缩”的基因组 。在酵母中几乎 70 % 的顺序是编 RNA 代谢 , 蛋 白折叠 , t rafficking , 和 降解 的功能 。 码 ORF 的 ,大约酵母基因组中每 2kb 可以找到一个 在较为复杂的生物中 ,随着功能不断地复杂 ,就会出 蛋白编码顺序 。而在线虫中则是每 6kb 有一个蛋白 现许多蛋白以执行其复杂的功能 ,而维持最基本生 编码顺序 ,在人类要 30kb 或更大的区域中才能找到 命活动的蛋白是保守的。两种物种中蛋白总数上的 一个蛋白编码顺序 。 差别是由承担各自特有任务的蛋白数 目的不同而造 12 　模式生物基 因组的 G + C % 比较高 。Fug u 成的。 (