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背包问题的闭环DNA算法.pdf
第20 卷第17 期 系 统 仿 真 学 报© Vol. 20 No. 17
2008 年9 月 Journal of System Simulation Sep., 2008
背包问题的闭环DNA 算法
1,2 1,2 2
周 康 ，同小军 ，许 进
（1.武汉工业学院 数理科学系，湖北 武汉 430023 ；2.华中科技大学 控制科学与工程系，湖北 武汉 430074 ）
摘 要：提出了闭环DNA 分子的结构多样性，即闭环DNA 分子在同一个位置上具有不同的DNA
序列。提出了双约束的整数规划背包问题闭环DNA 算法，即对变量取值进行DNA 编码并形成所
有可能解；用批接入实验、电泳实验和批删除实验筛选出可行解，用批接入实验、电泳实验得到最
优解；通过检测实验输出所有最优解。由一个算例说明算法的有效性。针对减少DNA 编码和内切
酶数量的问题改进了算法；对有特殊要求的背包问题提出了解决方法。
关键词：闭环DNA 计算模型；背包问题；批接入实验；批删除实验
中图分类号：TP301.6 文献标识码：A 文章编号：1004-731X (2008) 17-4605-04
Closed Circle DNA Algorithm of Knapsack Problem
ZHOU Kang 1,2, TONG Xiao-jun1,2, XU Jin2
(1. Department of Mathematics and Physics, Wuhan Polytechnic University, Wuhan 430023, China;
2. Department of Control Science and Engineer, Huazhong University of Science and Technology, Wuhan 430074, China)
Abstract: Molecular configuration diversity of closed circle DNA was brought forward, namely, closed circle DNA’s the
same position has different DNA sequence. For twin-restriction integer-programming knapsack problem, closed circle DNA
algorithm was put forward. In the closed circle DNA algorithm, DNA encoding for all values of any variable were encoded.
And all possible solutions were synthesized. Then all feasible solutions, which satisfied weight and capacitys needs, were
filtered out using group insert experiment, electrophoresis experiment and group delete experiment. And all optimization
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