建议确立蛋白质定名规则.pdfVIP

中国科技术语／2009年第3期 建议确立蛋白质定名规则 王克夷 最近几年参加了全国科学技术名词审定委员 编号；构成核孔的许多蛋白质就用NuP加数字表 会组织的《生物化学与分子生物学名词》(第二版) 示。这些符号为蛋白质的命名减少了很多麻烦。 审定和《英汉生物学大词典》的编撰，同时笔者编 至于对有明确生物学含义的基因所表达得到的蛋 写了《蛋白质导论》一书。在这过程中，深感蛋白 白质，通常是将斜体扶正，也即认为是对蛋白质的 质定名是一个非常复杂、令人烦恼和困惑的事。 定名，例如notch基因的表达产物，即定名为notch 早年蛋白质的命名相对比较简单，因为蛋白质 蛋白(质)。笔者认为不应简单地以外文定名，而 的研究是从分离、纯化和理化性质鉴定开始，而后 应该以其生物学意义对蛋白质命名或定名，notch 进行功能研究。蛋白质的命名就是根据来源、分离 基因的表达蛋白质应定名为刻缺蛋白。 的过程、理化性质和功能等特征来确定【lJ。译名确 蛋白质定名，更多的是蛋白质英文译名的确 定也比较简单，基本是直译。但是，由于早年技术 定，看似简单，但仍遇到很多问题。 条件的限制，对一些活性物质的结构特征还不了 首先是，很多学者，尤其是医学工作者，仍然喜 解，因此，在译名时，广泛地使用了“素”。除了抗 欢使用“素”，例如integrin被称为“整合素”。早年 菌素和维生素，很多物质也被称为“素”，某些蛋白 在不了解某种活性物质的属性时，使用“素”字无 质也不例外，胰岛素就是一个典型的例子。 可非议，如今已明确知道integrin是一类蛋白质，若 随着越来越多的物种的基因组完成了全序列 译名能反映其属性，则更确切。即“整合蛋白”(或 的测定，一个基因对应了一个蛋白质，为此，蛋白质 “整联蛋白”)比“整合素”合适；“泛蛋白”比“泛 的数量几乎在以指数曲线的形式增加。这就使蛋 素”更好。目前一些生物学出版物中，往往还是将 白质命名的问题更加突出。 两者并用【2】。对此笔者建议定一个原则，如果一个 基因的主要职责是负责遗传信息的传代和蛋 活性物质其属性已确定为蛋白质或肽，则其译名应 白质的编码，对它们的命名和定名似乎没有遇到什 尽量使用“某某蛋白”或“某某肽”，如defensin，可 么困难。与表型明确相关的，就用一个名词，如 定名为“防卫肽”而非“防卫素”。 lethal等。还经常给予基因一个 其次，在确定译名时，应尽可能地考虑到外文 notch、wingless、sex division 缩写和编号，例如参与细胞分裂调节(cell 名的由来，不必根据外文词直译。例如selectin曾 contr01)的基因为cdc，因有关的基因很多，就在其被译为“选择素”，其实其词根是lectin，含凝集素的 意义，将其译为“选择凝(集)素”或许更合理，简化 后加上数字编号，cdc4、cdc25等；一时还无法了解 其生物学意义的基因也可以用一个符号。 为“选凝素”则更简洁。同理collectin的直译则是 然而，蛋白质与基因却有明显的不同，因为提 “收集素”，根据外文的构词，其词根也是lectin，前 起蛋白质，一定会联想到它们的性质和功能。在功 缀col来源于collagen，全面考虑，则其译名以“胶原 能仍不清楚的情况下，对蛋白质的命名当然也可以