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Matlab在DNA功能片段分析中的应用.pdf
1
MatlabDNA
1 2 1
1(200240)
2 (200240)
kewen@
Matlab DNA
Matlab, DNA,
1.
[1]
1953 WatsonCrickDNA DNA
20 90 [2]DNA
[3]
Matlab
MatlabDNA
2.
Matlab Mathworks 1984
Matlab6.5
DNA
DNA dna.txtMatlab\work Matlab
dnas.mMatlab\work dnas.m Matlab
%
function dnas %
fid=fopen(dna.txt,r); DNA
s=fread(fid,char); DNA s
s=setstr(s); s
length_of_s=length(s) %DNA
b=atccg
length_of_b=length(b)
1
- 1 -
Freq=length(findstr(s,char(b))) %DNA
Pos=findstr(s,char(b)) %DNA
y=zeros(1,length(s)); %8 Pos
x=1:length(s); %x DNA 1,2,3…
if length(Pos)~=1 length(Pos)~=0
for i=1:length(Pos)-1
y(Pos(i):Pos(i+1)-1)=i; DNA
y
end
y(Pos(i+1):end)=length(Pos);
plot(x,y,*) %1
Int=diff(findstr(s,char(b)))-length(char(b)) %
%aaaaaaaaa -2
s=[*, s ,*]; DNA *
Bef=s(findstr(s,char(b))-1) %
A
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