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3l株野生铁皮石斛的rDNAITS序列分析
刘鹏,黄松, 张桂芳,陈念,赖小平’
(广州中医药大学中药学院,广东广州5lO006)
ITS序列,探讨利
[摘要】 目的:测定和分析31株不同产地来源的野生铁皮石斛样品的rDNA
用ITS序列推测铁皮石斛样品产地来源的可行性。方法:提取总基因组DNA,使用通用引物
l1.O提交Genbank。用
ITS5F/ITS4R进行PCR扩增,产物经电泳检测、纯化和测序后用Sequin
Bioedit
7.0中的Cl嬲tal
序列进行多重序列比对,随后以金钗石斛和密花石豆兰为外群,用邻接法构建NJ系统发育树。
所有已知的铁皮石斛的ITS序列及相关文献报道,对所有铁皮石斛ITS序列的起止位置进行精确
定位和编号,共发现645个同源位点,9个信息位点(ITSl区3个,5.8S区4个,ITS2区2个)。
系统发育分析发现,金钗石斛和密花石豆兰位于树的基部,另外32条铁皮石斛共同形成单个大
的分支,未发现产地来源与系统树的拓扑结构之间存在对应关系。结论:由于缺乏完善的铁皮石
斛标准品及其DNA参考序列的提交标准,同时单个ITS序列仅能提供有限的系统发育信息位点,
因此通过ITS序列分析的方法推测铁皮石斛样品的产地来源目前尚不具有可行性。
【关键词】铁皮石斛;内转录间隔区;系统发育分析:物种鉴定
ofrDNAlTS of3lWild
Analysis Sequence DP疗加6玩m嗷伽口,P
LIU Nian,LAI
Peng,HUANGSong,ZHANGGui-fang,CHENXiao-ping+
(SchoolofChineseMateria ofChinese 5l0006)
Medica,GuangzhouUniVersity Medicine,GuallgdongGuangz}lou
and rDNAlTS of31 strainsofdif.ferent
[Abstract】ObjectiVe:Tbsequenceanalyse sequences origin
ofwild the ITs to the
samples DP行d幻6f堋2班加口彪,discussfeaSibili哆ofusing sequenceidentify
of thetotalDNAand onthePCR
o“ginDP”西∞6f加竹班加口尼.Methods:Extractingcarring byusing
thePCR are andsubmined
primerITS5F/ITS4R,Thenproducts
toGenbankwith 1 ClastalWinBioed“7.Oto the ofall
Sequin1.0.Useing compare
multiplealignment
the33ITS ll submitted inthisanicle.Then
sequences,includingsequences use眈刀加6f“,”,z06f尼and
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