肺癌候选抑瘤基因HLCDG1片段的验证及全长序列的克隆.pdfVIP

理生理杂志 ChineseJournalofPathophysiology 2009，25(6)：1081—1088 · 1O81 · [文章编号] 1000—4718(2009)06—1081—08 肺癌候选抑瘤基因HLCDG1片段的 验证及全长序列的克隆 邹飞雁 ， 谢海龙。， 余艳辉 ， 欧阳咏梅。， 贺智敏。， 陈主初。 (暨南大学生科院生殖免疫研究所 ，广东 广州 510632；南华大学肿瘤研究所细胞生物研究室，湖南 衡阳421001； 中南大学湘雅医学院肿瘤研究所细胞生物室，湖南 长沙410078) [摘 要] 目的：对肺癌候选抑瘤基因HLCDG1片段 (已知序列)进行验证，并克隆其全长 eDNA序列。方 法：采用 RT—PCR和末端快速扩增技术 (RACE)，对正常人肺组织 中HLCDG1基因片段进行验证和克隆其全长 eDNA序列，登录基因数据库进行比对分析。结果：从正常人肺组织中钓取到HLCDG1基因未知的3’端和5’端序 列分别为 1304bp和 1548bp。HLCDG1基因与人酪蛋 白激酶 10【(CSNKIA1)基因2号转录变体相似性达99％， score=5544，E=0。结论 ：HLCDG1基因为已知的CSNKIA1基因的2号转录变体，可能参与肺癌发生发展。 [关键词] 基因，HLCDG1；基因，CSNK1A1；DNA末端快速扩增法；肺肿瘤 [中图分类号] R739．62 [文献标识码] A Testingand rapid amplification Of3’／5’eDNA end ofa candidatetumor suppressorgeneHLCDG1inhumanlungcancer ZOU Fei—yan ，XIE Hai—long ，YU Yan—hui，OUYANG Yong—me一l，HE Zhi— min ．CHEN Zhu—chu (InstituteofReproductiveImmunology，JinanUniversity，Guangzhou510632，China；LaboratoryofCellBiology，Cancer Institute，SouthChinaUniversity，Hengyang421001，China；LaboratoryofCellBiology，CancerInstitute，CentralSouth University，Changsha410078，China．E—mail：zoufeiyan6364@yahoo．tom．cn) [ABSTRACT] AIM：ToobtainHLCDG1fulleDNAsequencebasedonpartofknowncDNAsequencefromhuman lungcancer．METHODS：InhumanlungtissuetherapidamplificationofcDNAends(RACE)wasusedtoclone3’一ter- minal and5’一terminalofHLCDG1cDNA ，andidentifiedbysequencing，RT—PCR andBLAST．RESULTS：3’一termi— naland5’一temr inalunknowncDNA ofHLCDG1amplifiedwere1340 bpand1548bp，respectively．TheHLCDG1full— lengthsequencehadasequencehomologywithcaseinkinase1，alpha1，transcriptvariant2(CSNKIA1一TV2)，andthe identitywas99％ ，thescorewas5544 bits，andtheexpectwas0．CONCLUSION ：HLCDG1geneistheCSNK1A1 gene，whichwillbehelpfulforfurtherassessmentitsbiologicalfunction(S)incarcinogenesisoflungcancer． [KEYWORDS] Genes，HLC