化学计量学新算法及其在分析化学和生物信息学中的应用.pdf

摘要 摘要 近年来，化学计量学作为化学量测的基础理论和方法学，正日益得到国内学者的注意。 化学计量学为化学量测提供理论和方法，为各类波谱及化学量测数据的解析，为化学化工过 程的机理研究和优化提供新途径，它涵盖了化学量测的全过程，是--f]内涵相当丰富的化学 学科分支。化学计量学的发展为化学各分支学科、其中特别是分析化学、环境化学、药物化 学、有机化学、化学工程等，提供了不少解决问题的新思路、新途径和新方法。 近年来由于生命科学的研究和快速发展，对数据处理和分析提出了新的要求，形成了生 相互交叉而形成的--f]新兴学科。它通过对生物学实验数据的获取、加工、存储、检索与分 析，进而达到揭示数据所蕴含的生物学意义的目的。尽管生物信息学已经取得了很大的成绩， 但是由于生命行为的复杂性，人们距离揭开生命之谜并造福人类还有很长的路要走。正是在 生物信息处理中存在大量问题和机会，吸引了许多学科的研究人员加入到生物信息学的研究 之中，化学计量学家也不例外。 正因为分析化学和生物信息学最新的的发展趋势。本论文的主要研究目标就是对化学计 量学的新算法进行研究和发展，并将其应用于分析化学和生物信息学。我们的研究工作主要 包括以下几方面的内容： a．基于正交投影的化学计量学算法的研究和应用 论文工作期间，作者先后研究了大量现有的一些基于正交投影的化学计量学算法，并 综述了其中部分算法，在此基础上作者提出了两个全新的基于正交投影的化学计量学算法， 第一个是HLAE算法，作者首次提出利用浓度信息作为投影阵，对HLA算法作了很大的改 进。第二个算法是NOSC算法，首次将一直应用于二维数据的OSC算法扩展到三维数据。 并将二维的矩阵处理方法扩展到三维矩阵的处理上，取得了比较好的效果。 b．独立组份分析算法的发展 作者首次将独立组分分析算法(ICA)引入到分析化学领域，对算法进行了大量的研究， 包括算法和应用两方面。算法方面内容包括通过PCA事先确定主成份数，改变原始的同向红 外光谱线形组合作为ICA的输入的处理方法，改用纯组分的反向线性组台，作为ICA的输入。 从根本上改变ICA有时结果会很差的措施，保证了ICA产生结果的稳定性。应用方面作者验 证了红外光谱的独立性，将ICA应用到红外光谱体系中，对多组分混合红外体系进行分析， 同时应用ICA算法对红外体系的动力学光谱维和浓度维进行解析，取得了比较令人满意的效 果。 c．主成分分析、遗传算法和禁忌搜索在分子相似性的计算中的应用 将化学计量学方法引入分子相似性计算。将主成分分析法(PCA)、遗传算法(GA)以 II 摘要 及禁忌搜索(TS)用于3D分子相似性，建立了一个用分子静电势(MEP)评价的柔性的 3D分子相似性计算方法。 我们用该方法计算了苯及其衍生物、一组杀虫剂化合物和一组乙酰胆碱酯酶抑制剂的相似 P值的关系做了 性，并对结果进行了比较。在应用方面，我们对分子相似性与QSAR中log P之间有一定的线性关系。并用我们的分子相似性计算方法，对 研究，发现分子相似性与Iog HIV--1蛋白酶抑制剂TIBO衍生物的plC50做了预报。 关键词： 化学计量学主成份分析正交投影算法独立组份分析化学动力学遗传算法 Tabu搜索 lI Abs∞ct Abstract Inrecent thebasic and ofchemical years，as theory methodology measure， a role．Chemometricsisa whichhas chemometricsmoreandmore