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华东理工大学 《蛋白质组学》讲义 蛋白质组学(Proteomics) Outline of Proteomics 第一章 绪论 第二章 蛋白质组学的研究体系 第三章 蛋白质组学的应用与发展 第四章 蛋白质组学研究的实例 引言 生命科学的主要研究对象是什么？ 生命科学的核心是什么？ 传统蛋白质研究研究什么？ 基因研究－基因组研究 蛋白质组研究 生命科学的核心问题—生老病死 生命现象的过程及其变化 －发生和发展 解释疾病的发生 诊断和治疗疾病 传统蛋白质研究 研究对象：单个蛋白质 核心问题：结构和功能 由于蛋白质结构多变且各异，分离纯化不易，易失活，技术上存在困难，所以长期以来发展步子不 大 基因研究到基因组研究 基因是遗传信息的载体，可以视为生命活动的内在因素，推动生命generation to generation地稳 定且适应环境变化地延续下去。DNA （基因）的发现是生命科学的伟大里程碑，它将生命科学加速 度地推进了。 生物体是一个协调的整体，单个基因不能反映正确的整体信息 Biological Process( A simplified view ) Genome Genes Protein Protein Protein Physiological sequence sequence structure function activity 基因组学 Genomics Completely Sequenced Genomes （2001/2002） 4 /15 eucaryotes + (draft) human 9 /16 archaea 32 /89 bacteria 600 viruses 正在进行的基因组测序包括271原核生物和152真核生物。 SARS virus_coronavirus 1 华东理工大学 《蛋白质组学》讲义 功能基因组学基因组的表达 但是，完成了测序，并不一定知道基因组的功能 cDNA阵列 (cDNA microarray) DNA 芯片 (DNA chips) 基因表达序列分析 (Serial analysis of gene expression, SAGE) 表达序列标记 (Expressed sequence tag, EST) 蛋白质表达的调控 转录水平 DNA → mRNA 翻译水平 mRNA → Protein 翻译后水平 Protein → Modified protein 蛋白质存在形式和活动规律，必须依赖蛋白质本身的研究 “If the 1990s were the decade of genomics, the first three years of the new century are set to become the decade of the proteomics.” N.Leigh Anderson Current Opinion in Biotechnology,2000,11:408-412 “Proteins are central to our understanding of cellular function and disease processes, and without a concerted effort in proteomics, the fruits of genomics will go unrealized.”