一株芽孢杆菌16SrRNA的基因序列测定和系统进化分析.pdfVIP

广东农 、科学 2011年第 3期 12l 一 株芽孢杆菌 16SrRNA的基因序列 测定和系统进化分析 李瑞芳 ，赵玉峰 ，薛雯雯，田泱源 ，张长付 (河南：业大 ，：生物 T程学院 ，河南 郑州 450001) 摘 要：从河南黄河稻区土壤 中分离j“一株具有较强稻瘟病菌拮抗 活性的芽孢杆菌菌株 BS501，经过形态观察、生理生化特 性检测和 电镜技术 。确定其为芽孢杆菌属细菌 为进一步确定 分类学地位 ，扩增 了BS501基 因组 的 16S，DNA，并将测序结果提 交 CenBank数据 库 f登录号 ：FJ755787) 利用 BLAST软件 将 该序 列 f=i枯 草芽孢 杆菌 、地 农芽孢 卡下菌等芽孢 菌属细 菌及大肠 杆菌 16SrDNA 序列进 行 同源性 t-Lxq．系统进 化树 表 明 ．BS501与芽孢 菌属 细菌 存进 化 天系 组 成 一个火 的分 支 ，与枯草 芽孢 杆菌 最为 接 近 ，与 大肠 卡丁菌 较 远 。同源 性 分析 表 明该序列 与 枯 草芽孢 杆 菌 PRE23同源 性 达 99％ ，证实该 菌株 的分类 学地 位 为 枯草 芽孢 杆 菌 ： 关键词：芽他杆菌；l6SrDNA： 因测序 ；系统进化分析 中图分类号 ：R382．2 文献标识码：A 文章编号 ：1004—874X(2011)03—0l21—02 NSeeq(uencingaannddohylogeneticaannaably,ssiissot…theepmarrttiiaall ● - ， — — 16SrRNA in aBacillusstrain LIRui-fang ZHAO Yu—feng XUE Wen—wen，TIAN Yang—yuan，ZHANG Chang—fu (College(J厂Bioengineering,HenanUniversit)oJ’Technology,Zhengzhou450001，China) Abstract：A Bacillusstrain BS501which had strongantagonisticactivityof griseawasisolatedrfom thesollofricefield nearthe Yellow riverin Henan．BS501wasdetmm·inedto1)eaBacillusbacteriathroughmorphologicalobsen~ation，physiologicaland biochemical characterization and electronicmicroscopy．To furtherdeterminethetaxonomicstatusofthestrain，the 16SrDNA ofBS501genomewas amplified．an(ithesequencingresultwassubmittedtotheGenBankdatabase fGenBankaccessionnun)herisFJ755787)．Thehomologyof 16SrDNA sequenceofBS501andBacillussubtilis．Bacilluslichen Yrl~is otherBacillu~ spp and colwascomparedusingBLAST software．ThephylogenetietreeshowedthatBS501andBacillussppbaeteriaforf