大白菜脱水素基因的鉴定和特征分析.pdfVIP

2003)。本文利用比较基冈组学的方法，从大白菜的基因组中鉴定出9个新的脱水素基因， 并对这9个脱水素基因的遗传进化、编码蛋白的特征以及部分成员的顺式元件进行了分析， 为下一步研究大白菜脱水素基因的功能和利用大白菜脱水素基因改良其抗逆性奠定基础。 1方法和材料 利用拟南芥中的脱水素基因序列在Genbank中搜索比对大白菜的基因组序列和EST序 脱水素基因进行进化分析和预测编码蛋白的结构分析，对它们在巫细胞组分中的定位进行预 测，并对基因组序列已知的基因对其启动子及上游序列(1500bp)中的顺式调控元件进行分 析。遗传进化分析利用MEGA4．1来进行进化树的构建，采Bootstraptest-NeighborJoining方 FeatureScan 法， 蛋白结构分析通过PlantsP 重复500次运算。 2结果与分析 2．1大白菜脱水素基因的鉴定和特征分析 本文通过生物信息学分析从白菜基因组中鉴定出lO个脱水素基因，包括一个已报道的 et 基因COR25(Lua1．，2003)。其中6个新的脱水素基因是在基因组序列中发现的，三个是