基于机器学习的蛋白质亚细胞定位预测.pdfVIP

I蜀巨西司隘翌日l堡堕塑堕堕堡皇鱼 一 一． 基于机器学习的蛋白质亚细胞定位预测 PredictionofProteinSubnuclearLocationMachine Using Learning 郭丽丽’ 陈月辉 Yue—hu／ GUoK一琵CHEN doi：10．3969／j．issn．1672-9528．2011．05．19 鞫F’撼基因的表达使得蛋白质在核糖体内的合成成为可能，也使得遗传信息进行传递。蛋白质合成 后必须被转运到特定的亚细胞器中，才能正常发挥其生物学功能，使整个生命机体正常运转。 如果合成的蛋白质定位与其天然定位发生偏差，细胞的各种功能及其构成的生命机体将遭受 重大影响。 鞫皂键镶囊亚细胞定位特征提取分类器机器学习 AbstractGene makesit that be can inribosomesand infor- expressionpossibleprotein synthesized genetic mationcommunication．Themustbetransferredto cellafterthe that proteins specific synthesis，onlyway，proteins Can functionsandmakethe oflife normal．if biatheirnatural performbiological body operation proteins positions， theceHsanditsmadelife suffer influences． up organisimgreat SubnuclearlocationFeatureextractionClassifier Keywords Machine learning 蛋白质的亚细胞定位与其功能密切相关，同时是 不断深入，生物数据和生物序列迅速增长，单纯以传 维持高度有序的细胞系统正常运转的保障，研究蛋白 统的实验方法研究蛋白质定位，已经无法满足生命科 质的亚细胞定位¨j，有助于了解蛋白质性质和功能， 学研究的需要。近年来，基于机器学习方法的蛋白质 了解蛋白质之间相互作用和调控机制，为发明新药物 亚细胞定位预测逐渐成为生物信息学的一个研究热 提供参考信息。 点。 生物体细胞是—个高度有序的结构，胞内根据空 l亚细胞定位概述 间分布和功能不同，可以分成不同细胞器或细胞区 域，如细胞核、高尔基体、内质网、线粒体、胞浆和细胞 细胞是构成生物体(除病毒外)的基本单位，也 膜等。蛋白质在核糖体中合成后经蛋白质分选信号 是构成生物体的基本结构和执行功能的基本单位，是 引导后被转运到特定的细胞器中，只有转运到正确的 生物体进行正常生命活动的基础。生物体细胞之所 部位才能参与细胞的各种生命活动雌J。成熟的蛋白 以能够发挥其正常的