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植物学通报 2005, 22(3):267~275 Chinese Bulletin of Botany 特邀综述 古DNA及其在生物系统与进化研究中的应用 1,2 3 1 2 俞国琴 郑云飞 石春海 葛 颂 1(浙江大学农业与生物技术学院 杭州 310029) 2(中国科学院植物研究所系统与进化植物学院重点实验室 北京 100093) 3 (浙江省文物考古研究所 杭州 310014) 摘要 古DNA是指从已经死亡的古代生物的遗体和遗迹中得到的DNA本文回顾了近20年古DNA研 究所经历的3个阶段,从早期参与研究的科学家较少并主要利用克隆技术,到后来由于PCR技术的出现以 及提取化石DNA技术的成熟从而出现大量有关古DNA的报道;近几年由于发现不少问题,并引起激烈的 争论,科学家们因此而开始考虑古DNA的真实性问题,并且提出了开展古DNA研究的严格标准 本文还 讨论了古DNA在人类起源 系统发育重建 动植物驯化及考古研究中的重要意义以及现状,表明古DNA 的研究给某些原先的观点如人类的非洲起源说提供了重要证据,也对某些观点提出了挑战;古DNA研究 还提供了某些已经灭绝生物的形态学和分子资料,为从序列上确定古代材料的系统位置并有效地补充仅 用现代DNA建立起来的谱系提供了来自古生物的依据 在动植物驯化及考古方面,古DNA证据也为科 学家提供了许多有价值的信息 最后,本文还对古DNA研究的应用前景进行了展望 关键词 古DNA,系统发育,进化,动植物驯化 Evolutionary Biology 1,2 3 1 2 YU Guo-QinZHENG Yun-FeiSHI Chun-HaiGE Song 1(College of Agriculture and Biotechnology, Zhejiang University,Hangzhou 310029) 2(Laboratory of Systematic and Evolutionary Botany, Institute of Botany, the Chinese Academy of Sciences,Beijing 100093) 3(Zhejiang Cultural Relic Archeological Institute,Hangzhou 310014) Abstract 中国科学院知识创新工程重要方向项目(KSCXZ-SW-101A)资助 通讯作者 Author for correspondence. E-mail: gesong@ibcas.ac.cn 收稿日期: 2004-02-17接受日期: 2004-06-09责任编辑:崔郁英,于昕 268 22(3) and trends of ancient DNA study are reviewed. Key words 古DNA(ancient DNA)是指从已经死亡的 的研究历史至今虽然才20年,但它的重要性在 古代生物的遗体和遗迹中得到的DNA,通常分 许多研究领域,特别是人类和动植物起源和进化 为两大类:一类是从博物馆标本 古代生物尸 方面日渐明显 综观其发展历程,大致可以划 体及琥珀等软组织中提取的DNA;另一类存在 分为3个阶段 于古代动植物化石中,必须经过打磨 液氮裂 1984~1989年,古DNA研究的科学家并不 解和脱钙等预处理后才能提取出DNA(Pabbo,多,所采用的方法主要是利用当时的克隆技术 1990)生物系统学是研究生物类群之间的关 由于古DNA毕竟经过漫长的历史,氧化作用 系以及生物进化式样及机制的科学,其研究的主 水解作用及环境微生物降解等作用的存在,古 要对象是现存的生物 对于已灭绝生物,生物 DNA分子受到严重破坏,基本降解殆尽或仅有 学家只能得到一些残缺不全的形态信息及历史 少数残余,而且这些残余的分子也