建立酶切图谱法从日本历年本土基因型麻疹病毒株中鉴别中国输入株H【因型麻疹病毒]基.pdfVIP

·--— — 582 --·—— ChinJklI)Di岬 ，December。2004，Vol8，No．6 文章编号：1007—4287(2004)06—0582—03 建立酶切图谱法从 日本历年本土基因型麻疹病毒 株中鉴别中国输入株 H]【基因型麻疹病毒 周剑惠 ，常 新 ，陈 超 ，许 强 ，刘 影 ，李大强 ，张书娟 ，中山哲夫 (1．吉林省疾病预防控制中心，吉林 长春 130021；2．吉林大学生命科学学院； 3、一汽总院安庆社区；4、日本北里大学北里生命科学研究所，东京 108—8641) 摘要：目的 本文主要研究建立一种酶切图谱法从 日本历年本土C1、D3、D5基因型麻疹病毒中鉴别中国输入株 H1基因型麻疹病毒，即逆转录多聚酶链式反应一限制性片段长度多态性分析方法(RT-PCR—RFLP)。方法 对 C1、D3、 D5及Hl基因型麻疹病毒H基因全长的序列进行分析，寻找能够从 日本本土株中鉴别出输入株 I{1基因型麻疹病毒 的限制性 内切酶酶切位点，建立RT-t~2R—RFLP方法。同时，我们又应用多株 已经过序列分析确定为 C1、D3、D5、II1基 因型的麻疹病毒用该 RT-t~R-RFLP方法进行验证。结果 应用该 RT-PCR-RFLP方法所得结果与序列分析方法结果 一 致。结论 该 RT-PCR一1WLP方法是一种简单、快速又实用的从 日本本土株中筛查 Hl基因型输入株的方法。 关键词：麻疹病毒；逆转录多聚酶链式反应(RT-PCR)；限制性长度片断长度多态性分析(RFLP)；电泳；序列分析 中图分类号 ：R373．11 文献标识码 ：A Theestablishmentofa|Ie~ me-cutmethodforidenti聊ngiml~rtedcl~esemeasles~rusesofIllgenotypefromJapanese nle~．slesvirusesofindigenousgenotypesZHOUJiar~-h ，CHANGXin，CHENGChao，etol、(CenterforDiseaseComrolandPre— ventionofJilinProvince，Changchun130021，China) Abstract：Objective Weestablishedallenzyme—cutmethodforidentifyingimportedChineseH1genotypemea~．]esvirusesfrom JapaneseC1、133、D5genotypemeaslesvirusesRT-PCR-RFLPmethod．Methods Weana1yzedtheseqlleneeofthewholeHgeneof Cl、D3、D5genotypemeaslesvirusesforseekingtherestrictionenzymesite，whichcanidentifyimportedChinesegenotypefromJapa- nesemeaslesvirusstrains，andthenestablishedtheRT-PCR-RFLPmethod．AtthesaIll~time，wedemonstratedthismethodbyusing ittotestmanystrainsofmeaslesviruseswhichweredeterminedasC1、D3、D5andH1genotypes．Results TheresultsoftheRT- PCR-RFtP methodwerethesamewiththoseofset~lenceanalysis．Colldu 0lI ThestudyshowedthatthisRT-PCR-RFLPmethod wasasimple，rapidandapplicablemethodtoidentifyimportedH1genotypefromJapanesegenotypesofmeaslesviruses． Keywords：measlesvirus；reversetranseripon．p0lyInerasechainreaction(RT-PCR)；restr