基于靶点网络的参仙冰抗心肌缺血有效成分群的研究.pdfVIP

基于靶点网络的参仙冰抗心肌缺血 有效成分群研究 顾浩 张燕玲 王耘 马群 乔延江 北京中医药大学中药学院，北京 100102 摘要：参仙冰是根据临床经验组方的抗心肌缺血有效方剂。在参仙冰基础上进一步开发成分相对明确、作 用机制基本清楚的现代中药是心肌缺血临床治疗的紧迫需求，因此需要对参仙冰中抗心肌缺血有效成分群进行研 究，以便能够根据关键有效成分群设计提取工艺和优化组方。本研究利用实验室前期构建的中药有效成分族群快 速辨识平台，发现参仙冰有效成分群及其作用靶点；利用实体语法系统推理规则，以生物网络为背景推断药物作 用靶点与疾病相关蛋白的相互作用关系，从而系统解析参仙冰有效成分群及其对心肌缺血的分子作用机制，为设 计提取工艺和优化组方提供依据。 关键词：有效成分群；虚拟筛选；生物网络；实体语法系统；心肌缺血 IdentificationofactiveclusterfromShenXianBingFormulaonanti-myocardial ischemiaandanalysisofitstherapeuticmechanismsindrug-targetnetwork GU HaoZHANGYan-lingWANG YunMAQunQIAOYan-jiang SchoolofChineseMateriaMedica,BeijingUniversityofChineseMedicine,Beijing100102,China Abstract:ShenXianBingFormulaisaneffectiveprescriptionretrievedfromclinicalexperimentonanti-myocardial ischemia.WewanttodevelopanewformulacomposedofeffectivecomponentsinShenXianBing(whicharecalledanactive cluster)andclarifyitstherapeuticmechanismindrug-targetnetwork.Firstofall,wemustidentifytheactiveclusteronanti myocardialischemia.OurlaboratoryhasalreadybuiltupanactiveclusterfastidentificationplatformonTCM.Basedonprevious work,wehaveidentifiedtheactiveclusterinShenXianBingFormulaandfoundoutitseffectivecomponentsandcorresponding targets.Usingentitygrammarsystem,webuiltupadiseasenetworkonanti-myocardialischemiaandinducedtheinteractionsof activeclustertargetsandtherapeutictargetstoclarifytheanti-myocardialischemiamechanism.Theresultsofthispaperasaclue andreferencecanbeusedtofurtherdevelopmentofShenXianBingFormula. Keywords:Activecluster;Virtualscreening;Bio-network;Entitygrammarsystem;Myocardicalischemia 中华中医药杂志(原中国医药学报)2013年5月第28卷第5期CJTCMP，May2013，V01．28，No．5 关系。 化学成分数据来源于中药数据库(TCMD)2009…】， 由于中药化学成分及其作用机制的复杂性，利 中国中医药管理局中药基础信息数据库(ht啦／／dbsha弛． 用传统的有效成分提取和活性筛选策略不具备现实 21。 的可行性。为此，文章针对参仙冰主要成