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启动子分析篇.doc
启动子功能分析篇
研究背景
启动子是基因的重要组成部分,它的主要功能是控制基因表达(转录)的起始时间和表达的程度。启动子就像“开关”,决定基因的活动。但启动子本身并不控制基因活动,而是通过与转录因子结合而控制基因活动。启动子一般分为广谱表达型启动子、组织特异性启动子、肿瘤特异性启动子等多种形式。基因的启动子部分发生改变(突变),则可能导致基因表达的调节障碍。这种变化常见于恶性肿瘤。
鉴于启动子的重要功能,目前对启动子的研究仍旧是一个热门话题。
通常含一些特定的元件,如TATA box
具有方向性:启动下游的基因的表达
启动子长度的不确定性
一个基因通常含有多个启动子,启动不同转录本的表达
某些启动子具有表达的时空性和组织特异性。
研究思路
对启动子功能及结构的研究,可以从以下几个方面着手:
1)启动子结构研究,包括核心启动子区域、正调控区域、幅调控区域及增强子的确定
2)组织特异性启动子筛选及确定
3)转录因子与顺式作用元件相互作用研究
3)启动子甲基化作用研究
4)新顺式作用元件发现及功能鉴定
研究路线
1.DNA提取;基因克隆;载体构建;生物信息学预测;细胞培养及转染;双荧光检测;甲基化检测;qPCR;9EMSA;10chIP等。
启动子是基因的重要组成部分,启动子就像“开关”,决定基因的活动。
启动子活性的异常,则可能导致基因表达的调节障碍,从而有可能导致疾病的发生
找到组织特异性启动子,为靶向治疗提供可能
找到某些疾病关键基因异常表达与启动子的关系,为基因治疗提供可能
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