肿瘤微阵列数据统计分析概述.pdfVIP

生 技 术 通 讯 … 25～ ． LETTERSINBIOTECHNOLOGY VOI． NOO6·Nov．,Z2O0I144 875 TT doi：10．39696．issn．1009—0002．2014．06．030 综 述 肿瘤微阵列数据统计分析概述 张杨 ，张威 ，曹文君 ，李运明 ，陈长生 1．第四军医大学 军事预防医学院卫生统计学教研室，陕西 西安 710032； 2．长治医学院 基础部，山西 长治 046000；3．成都军区总医院 神经外科，四川 成都 610083 [摘要] 微阵列技术已广泛应用于生物学和医学研究领域，如肿瘤的诊断和分型、预测和治疗，理解肿瘤的发生机 制、生物学通路和基因网络。统计学方法在这一科学挑战中的地位至关重要。我们综述了微阵列实验数据分析的统 计学方法最新发展 ，主要描述 了微阵列数据的标准化、差异表达基因的统计学检验及微阵列技术在肿瘤治疗 中的应 用，重点介绍了时间序列微阵列数据分析方法和基因调控网络在肿瘤研究中的最新发展。 [关键字] 肿瘤；微阵列数据；标准化；差异表达基因；诊断及分型；时问序列；调控网络 [中图分类号] R730；Q811．4 [文献标识码] A [文章编号] 1009—0002(2014)06—0875～05 Overview ofStatisticalAnalysison CancerM icroarray Data ZHANG Yangl，ZHANG Wei，CAO Wen—Jun ，tL1Yun—Mingl，CHEN Chang—Shengl 1．DepartmentofHealth Statistics，Preventive Medicine College，Fou~h Military MedicalUniversity，Xian 710032； 2．ChangzhiMedicalCollege，Changzhi046000；3．Chengdu HospitalofPLA，Chengdu 610083；China Correspondingauthor,E—mail：chencs@fmmu．edu．1311 [Abstract] Microarraytechniqueshavebeenwidelyusedtomonitorgeneexpression inmanyareasofbiomedi— calresearch．Such asthe diagnosis and classification，prediction and treatmentoftumor，understanding the mecha— nism oftumor，biologicalpathwaysand genenetworks．Statisticalmethodsarevitalforthese scientific endeavors．In this articlewe reviewed recentdevelopmentsofstatisticalmethodsofranalyzing datafrom mieroarray experiments． Mainly described the standardization of mieroarray data，statisticaltests of differentially expressed genes，and the application ofthe microarraytechnology in tumortreatment．Emphasisintroduced time seriesmieroarray data analy— sismethod and the latestdevelopmentin the studyofgeneregulatory networksin tumor． [Keywords] tumor；microarraydata；normalization；differentiallyexpressedgenes；cl