人类群体遗传空间结构对应分析中的蹄型效应及其遗传学解释.pdfVIP

遗 　传 H ER ED I TA S (B eij i ng) 27 (6) :972～979 ,2005 遗传学教学 人类群体遗传空间结构对应分析中的“蹄型效应” 及其遗传学解释 1 1 2 1 薛付忠 ,王洁贞 ,郭亦寿 ,胡 　平 ( 1. 山东大学公共卫生学院流行病学与医学统计学研究所 ,济南 2500 12 ; 2 . 山东大学医学院医学遗传学研究所 ,济南 2500 12) 摘 　要 :探讨了人类群体遗传结构对应分析中“蹄型效应”的产生机制及其遗传学解释 。从分析基因频率矩阵的结 构特点入手 , 以实例验证和比较了对应分析中散点图的结构特征 。发现当基因频率矩阵的结构不同时 ,其对应分 析中散点图的分布模式不同;当基因频率矩阵中存在稀有基因时 ,其对应分析的散点图则呈现明显的“蹄型效应”。 2 “蹄型效应”经常会歪曲潜在遗传结构的真实形态 ,其产生主要是因为对应分析中的 χ 距离不相似测度高估了稀 有基因的作用 。在人类群体遗传结构对应分析中 ,当出现“蹄型效应”效应时 ,需认真分析基因频率矩阵的结构 ,寻 找“蹄型效应”产生原因并给出合理的遗传学解释 , 以免做出错误结论 。 关键词 :人类群体遗传结构 ;对应分析 ;蹄型效应 中图分类号 :Q987 　　　文献标识码 :A 　　　 文章编号 :0253 - 9772 (2005) 06 - 0972 - 00 The “Hor seShoe Effect ”of Cor re spo n dence A naly si s for Hu man Pop ulatio n Genetic St r uct ure an d it s Pop ulatio n Genetic Exp lanation XUE FuZhong1 ,WAN G J ieZhen1 , GUO YiShou2 ,HU Ping1 ( 1. Dep t ment of Epidemiology and Bio st ati stics , School of Public Healt h , Shandong U niver sit y , J inan 2500 12 , China ; 2 . Dept ment of Medical Genetics , Medical College , Shandong U niver sit y ,J inan 2500 12 ,China) Ab st ract :At p resent st udy , t he reason s of “hor seshoe effect ”in correspondence analysi s for analyzing human pop u lation genetic st ruct ure wa s exp lained . Based on t he st ruct ure of gene f re