电子细胞AnalogCell地并发机制.pdfVIP

第4期 电 子 学 报 Ⅷ．37N0．4 ACrA 加09年4月 EU￡CⅡ踟CASlNICA Apr．2009 电子细胞Analog—CeU的并发机制 匦圈1”，行 荣-一，卢欣华-一，韩霄松1，2 (1．吉林大学计算机科学与技术学院，吉林长春130012；2．吉林大学符号计算与知识工程教育部重点实验室，吉林长春130012) 中定量的随机控制机制以及模拟细胞中砌忱聚合酶介导转录起始过程的算法模型，可有效地避免系统中随机错误的 发生并提高运行效率；最后，提出了并发Analog．ceu模型中DNA转录过程的模拟算法． 关键词： 电子细胞；并发约束程序；生物建模 中图分类号： Q811．4 文献标识码： A 文章编号： 0372．2112(2009)04-0786-06 Framewo水ofCOncurrent AnaIog—Ce¨ suN Ji-guil，_，ⅪNGRo耐一，LU)【in．I啪1一，H心Xia0．8∞一·2 (1-脚矿cD咖‰口，ld乃dl，蝴，肋l‰盼，c7l叫酬m，埘讥130012，踟m； 2．研岫旷舭蛳溉删㈣魄概咖矿胍嘶矿臌删拥，肋lⅢm蚵，‰咿‰，胍130012，‰) attbe i玎fom删on．w色c硎ed AIⅪ妇ct：An衄aIⅡ坞芦髓即扭ge鹏a【p9[e：滴onmol讪levcl．It口D、树髓址啊1daI吐iIl诅gc 咖嘶硎鲥吣∞c0IlcI埘咖删c砌ysis0fAllal喈例iIltllispaper．weiI彻幽cedcon删鼬n邺幽Am- alld a缸咖础0f a st(dla衄c0曲Dl lo哥QIupf鹳即主ed q∞删ve mechal衄， c0∞町眦ek斌唧血ceⅡlI的del．W色蚓印ed 0f of 懒w鹊based∞曲shIdy stc蛐c0眦叩删c0璐向m硼昭mm吐ng．Itis嘲)a1)le aIld 0f on c0椰灯aim iIl中∞vil唱ttlepedhmar髓e街dencyAnalo分olu．BasedI髓卜detej删stic佃q删c0帆珊瑚lttIl∞ry，wepm- not 湖涮锄alg耐陆∞ddto蛐幢蛐0f咖蛐．豳blnl∞st，we删觚蛐t0蛐舭 心mscrip妇珥D‘：e鼯． Key帅ndS：da舯nicoen；col娜撇吐砌砌疵邮舯舳ing；bio姆caln10dd崦 展，引领生命科学研究演化为运用高通量实验技术获取 l引言 海量生物信息，并在这些生物信息基础上建立物理、数 电子细胞在计算机上模拟细胞的功能结构、物质组 学模型，最终通过建模与实验相接合的研究手段来定量 成以及生命活动的动力学行为和生命现象．用虚拟现实 阐述生命现象的本质规律的定量研究方法【2J．电子细胞 的方式实现友好人机交互，以便研究者构造细胞结构和 通常采用动态的、混合的、离散的建模方法，将半定量模 其内外部环境的物质组成，考察、记录细胞