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非小细胞肺癌的血清蛋白质组学研究 摘要 目的： 目前肺癌诊断缺少有效的早期诊断方法，通过对非小细胞肺癌患 者血清及正常对照的血清作蛋白质组学分析，运用血清蛋白质组学技 术把两者区分开来，并探索新的肺癌生物标志物以达到早期诊断的目 的。 方法： 首先通过非标记定量一维液相色谱串联质谱的方法，分析了8例非 小细胞肺癌患者及8例正常对照血清，对得到的血清蛋白质数据运用 生物信息学统计方法包括系统聚类分析及主成分分析等方法进行统计 分析。在此研究基础上，我们进一步对8例肺腺癌、5例肺鳞癌及5 例正常对照血清样本运用二维液相色谱串联质谱技术进行分析，对得 到的肺癌血清蛋白质组数据继续运用生物信息学方法进行统计分析， 并从差异表达的蛋白质中通过文献复习寻找有作为肺癌生物标志物潜 力的蛋白质。 结果： 本文第一部分中，我们采用液相色谱串联质谱的非标记定量技术 对8例正常人血清和8例非小细胞肺癌患者血清进行分析，这16例样 品共得到含有3358个定量信息蛋白质的数据库，通过归一化和随机配 对t检验(pO．05)后，得到62个差异表达的蛋白质，有208种蛋白 质在16例血清样本中均表达。采用这62个蛋白质，进行系统聚类分 析显示，可以通过这组蛋白从整体上将正常人和肺癌患者区分开来； 进一步，我们采用主成分分析、支持向量机等生物信息学方法进行分 析，得到了一系列可能与肺癌的发生、发展及预后相关的蛋白质。 本文第二部分中，我们根据文中第一部分的实验结果，进一步对8 例肺腺癌患者血清、5例肺鳞癌患者血清及5例正常对照采用基于二 维液相色谱分离串联质谱的非标记定量技术进行分析，通过对蛋白质 样品分离技术的改进，鉴定到的蛋白质数目由原来的300个左右／例增 至1000个左右／例。采用326个差异表达蛋白质，进行系统聚类分析 显示，可以通过这组蛋白质从整体上将正常人、肺腺癌及肺鳞癌患者 区分开来；在三类血清样本蛋白质数据主成分分析中，有一例正常样 本及肺腺癌样本与肺鳞癌不能很好区分。同样通过86种差异表达的蛋 白质，可以把正常与肺腺癌患者进行区分；通过162种差异表达的蛋 白质把正常对照与肺鳞癌区分；同时，我们在肺腺癌与肺鳞癌中鉴定 出了103种差异表达的蛋白质，系统聚类分析可以从整体上把两者很 好的区分。 结论： 肺癌患者血清与正常血清存在着差异蛋白质组，并且不同肺癌亚 型之间血清蛋白质组不同，可能存在着新的潜在肺癌生物标志物。非 标记定量蛋白质组学技术可能将来会成为一种很好的肺癌辅助诊断手 段，并是一种很好的寻找肿瘤生物标志物的方法。 关键词 非小细胞肺癌，蛋白质组学，液相色谱串联质谱的非标记定量技术， 诊断，生物标志物 THESERUMPROTEOMICANALYSIS OFNoN—SMAI。L．CELLLUNG CANCER ABSTM objective： To non·-small··cellcancerfromthenormalcontrols distinguish lung and thenew biomarkersof cancerselunl explore potential lung by proteomicstechnology． Methods： In thefirst tandem part，label-freequantitativeliquidchromatography mass was on8 spectrometry(1D-LC／MS／MS)analysisperformed non-small—cell and8normalcontrols．