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绰墩山遗址古水稻土细菌与古菌群落的PCRDGGE分析
第28卷第6期 生 态 学 报 V01.28,No.6
2008年6月 ACTAECOLOGICA$INICA Jun.,2008
绰墩山遗址古水稻土细菌与古茵群落的
PCR.DGGE分析
申卫收1,2,一,尹睿1一,林先贵1’2一,褚海燕1”,胡正义1,曹志洪1·2
(1.中国科学院南京土壤研究所上壤与农业可持续发展国家重点实验室。南京210008;
2.中国科学院南京土壤研究所—香港浸会大学土壤与环境联合开放实验室,南京210008;3.中国科学院研究生院,北京100049)
a的新石器时期灌溉古水稻田土层和距
摘要:在江苏苏州绰墩山遗址考古发掘中,发现了在剖面不同深度埋藏的距今约6280
今约3320a的商周时期的古水稻田土层。为了解古代水稻种植活动对土壤中细菌、古菌及产甲烷古菌群落多样性的影响,以
cm土壤母
土壤剖面P.01(包含100~116cm新石器时期水稻土,42~57cm商周时期水稻土,0—15cm现代水稻土和174—200
质)为对象,利用细菌、古菌及产甲烷古菌群落16S
菌及产甲烷古菌群落多样性。结果表明:利用PCR—DGGE技术成功获得了古水稻土细菌、古菌及产甲烷古菌群落的分子指纹
图谱。现代水稻土、商周时期古水稻土和新石器时期古水稻土中细菌、古菌及产甲烷古菌群落的DGGE条带类型各不相同,并
且DGGE条带类型都较母质层丰富多样。UPGAMA聚类分析可以将不同时期水稻土及母质层的细菌、古菌及产甲烷古菌群落
区分开来。埋藏古水稻土中仍有较多的细菌、古菌与产甲烷古菌存活。与母质层相比,不同时期水稻种植活动均增加了细菌、
古菌与产甲烷古菌群落多样性。不同时期水稻种植活动可以引起特异性的细菌、古菌与产甲烷古菌群落发育,而且不同的栽培
措施可能导致不同的优势种群。
关键词:古水稻土;新石器时代;DGGE;古菌;产甲烷古菌
文章编号:1000—0933(2008)06.2916.09中圈分类号:Q3496,Q938。St54.36文献标识码:^
PCR.DGGEofbacterialandarchaeal diversitiesinancient
analyses community
soils inChuodunshan
paddydiscovered Site,Suzhou,China
SHEN
Wei—Shoul·2·3,YINRuil-2,LINXian.Guil·2t+,CHUHai.Yanl,2,HUZheng.Yil,2,CAOZhi—Hon91·2
1 State andSustainable
tarLaboratoryofSoil Agriculture,InstituteofSoilScience。ChineseAcademyofSciences,Nanjing210008,Ch/na
2 the Scienceand
Joint and Environment,Institute gongBaptistWni,删ty,Nanj/ng210008.Ch/na
OpenLaboratoryo,Soil ofSoil Hong
3Graduate Chinese
Universityof Academyofsc如rⅢ,咖曙100049,Ch/na
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EcologieaShll正ca,2嗍.28(6):2916—2924.
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