GATK使用方法.docxVIP

原创】GATK使用方法详解（包含bwa使用）第一部分 ? (2014-03-03 11:07:29)  HYPERLINK javascript:; 转载▼ 标签：?  HYPERLINK /?c=blogq=gatkby=tag \t _blank gatk ?  HYPERLINK /?c=blogq=bwaby=tag \t _blank bwa ?  HYPERLINK /?c=blogq=snpby=tag \t _blank snp ?  HYPERLINK /?c=blogq=indelby=tag \t _blank indel分类：? HYPERLINK /s/articlelist_5056118076_1_1.html \t _blank 生物信息由于新浪博客规定，每篇文章不可超过2万字符，因此分4篇发布。 一、使用GATK前须知事项： （1）对GATK的测试主要使用的是人类全基因组和外显子组的测序数据，而且全部是基于illumina数据格式，目前还没有提供其他格式文件（如Ion Torrent）或者实验设计（RNA-Seq）的分析方法。 （2）GATK是一个应用于前沿科学研究的软件，不断在更新和修正，因此，在使用GATK进行变异检测时，最好是下载最新的版本，目前的版本是2.8.1（2014-02-25）。下载网站：