柠檬酸杆菌O抗基因簇RFLP分型及5个O血清型基因簇的破译.pdfVIP

摘要 摘要 酸杆菌是人类及动物肠道内的正常菌群，并且也普遍分布在自然环境例如土壤、 水、污水及食物中。它们是条件致病菌，可能引起严重的人类感染，例如肠胃 炎、尿道感染和呼吸道感染，尤其是在婴儿、儿童及免疫功能不全病人体中， 有时也可能与脑膜炎、脑脓肿和新生儿败血症有关。 柠檬酸杆菌的O抗原结构高度多变，大约有30多种O抗原的组成和结构 已得到阐释。但是，目前其O抗原基因簇的研究还处于空白阶段。柠檬酸杆菌 的O抗原基因簇与大肠杆菌的类似，一般位于细菌基因组的ga／F和蒯基因之 间。本研究对柠檬酸杆菌血清型标准株的。抗原基因簇进行了PCR．RFLP分型， 并且完成了5个柠檬酸杆菌血清型05、06、012、013和035的O抗原基因 簇的测序和分析。 通过对柠檬酸杆菌血清型标准株的O抗原基因簇的PCR．RFLP分型，我们 发现基于。抗原基因簇的PCR—RFLP分型与其O抗原基因簇以及O抗原结构 是相对应的，并验证了O抗原基因簇与血清型相关的多样性，同时还发现了血 清分型与利用O抗原基因簇进行的PCR．RFLP分型之间存在的差异。基于O抗 原基因簇的PCR-RFLP分型比传统血清分型的分辨力高，且其适合于长期流行 病学监测。 此外，通过生物信息学分析我们测得的这5株菌的。抗原基因簇，我们发 现：O抗原基因簇中的大部分基因的GC含量均在30％左右，明显低于柠檬酸 杆菌基因组的平均GC含量水平；其O抗原基因簇中含有其O抗原结构中罕见 单糖的合成酶基因、寡糖单位处理酶基因以及所需的糖基转移酶基因。但是， 并非所有的罕见单糖合成酶基因都存在于O抗原基因簇中。而且柠檬酸杆菌O 抗原合成途径有典型的Wzy-依赖型和ABC转运子依赖合成型两种。 关键词 柠檬酸杆菌O抗原结构O抗原基因簇PCR．RFLP分型 abstract Abstract Membersofthe Citrobacterate tothe genus Gramne-gative，belongingfamily ale areinhabitantsofhumanandanimal also Enterbacteriaceae．They intestines，and distributedinnaturalenvironmentsuchas andfood． commonly soil，water,sewage Citrobacterstrains isolatedfromwoundsale and frequently oppommisticpathogens cause diseases tractinfectionsand in urinary bacteremias，especially gastrointestinal incidentsof abscessesand immunocompromisedpatients；some meningitis，brain inneonateshavealsobeen sepses reported． ThestructuresofCitrobacter ale the diverse，and