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深海热液区非培微生物基因资源的功能选及研究.pdf
摘要
摘要
深海热液区具有高温、高压、剧烈化学梯度和pH梯度等特征,属于地球上
最极端的环境,其中蕴含着丰富独特的微生物资源。这些微生物在长期的环境适
应过程中形成了自身独特的代谢机制,可能产生一些比较特殊的次级代谢产物,
非常有助于对海洋天然药物和新颖生物活性分子的开发利用。
分子生态学研究发现,绝大部分的海洋微生物是不可培养的,仅有极少数的
微生物能够被分离鉴定出来。采用宏基因组学技术,能够获得自然环境中所有可
培养微生物和不可培养微生物的全部基因。它能够克服纯培养的局限性,有利于
深海热液区微生物基因资源的研究。
本文对7个宏基因组文库共计26600个克隆子进行了抗细菌、抗真菌、抗肿
瘤等活性筛选。
以枯草芽孢杆菌和金黄色葡萄球菌作为指示细菌,采用双层琼脂平板法从
个活性克隆,从Fosmid文库3.11.8中筛选到3个活性克隆,筛选活性克隆分别
占它们各自文库克隆的0.0635%,0.153%,O.15%。
以酿酒酵母和白色念珠菌作为指示真菌,采用滤纸片琼脂扩散法对上述15
个活性克隆进行抑菌实验,发现其中9个克隆子具有抗真菌活性。
以HTl080和BEL7402肿瘤细胞系为筛选模型,采用CCK.8法对上述9个
产色素活性克隆子进行筛选,发现其中3个克隆子具有较好的细胞毒性。
在对文库进行活性克隆筛选的过程中,意外地发现一些活性克隆子能够产生
色素。本文选取了其中5个产色素较为稳定的活性克隆子进行转座突变,结果发
现转座突变使编码sigma54-依赖性转录调控因子或苯酚羟化酶的功能基因失活
后,会导致色素缺失现象。
以金黄色葡萄球菌为指示菌,对活性克隆子25D7的色素缺失突变子进行抑
菌试验,发现色素缺失突变子的生物活性消失。在文库克隆筛选中,色素可作为
~个初步的筛选标记,有利于快速判断外源基因是否在宿主体内获得表达。
子的抗肿瘤细胞活性筛选,从中分别筛选到6个活性混合克隆子和1个活性混合
——————————————————————羔堕L——————一一
克隆子,这些混合克隆子具有一定的细胞毒性。
研究发现,滤纸片琼脂扩散法和双层琼脂平板法相结合,对文库进行高通量
筛选,可以有效避免出现活性克隆假阳性和漏筛;文库构建前,对样品进行放线
菌和真菌等的富集,有助于提高筛选效率。
关键词:深海热液区;宏基因组文库;转座突变;功能筛选
Ⅱ
Abstract
on
mostextremeenvironmentse酬【n,
the
vents,among
hydrothermal
Deep.sea
chemical
gradients,pH
the pressure,sharp
ch跚.acterizedhightemperature,high
arc by
orderto to
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lots microorganisms·In
andSO special
gradientson,containing
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extremeenvironments,thesemiroorganisms uni
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