东方粘虫颗粒体毒和斜纹夜蛾核型多角体病毒Ⅱ基因组全序列分析.pdfVIP

摘 要 杆状病毒是已知昆虫病毒中最大的类群，呈杆状，仅感染无脊椎动物，具有大的双链，共价 闭合，环状的DNA基因组。杆状病毒基因组的测序和分析对于我们理解基因功能和它们的进化 是非常重要的，正是由于已经有大鼍的杆状病毒基因组已经被测序，方便了我们对病毒基因组的 进一步的了解而进行详细的比较分析。本研究主要对两种杆状病毒：东方粘虫颗粒体病毒(PsGV) 11)基因组进行序列测定和分析。 和斜纹夜蛾核型多角体病毒II(SpltNPV II的形态学特性 1．PsGV和SpltNPV 根据包涵体形态的不同，将杆状病毒分为NPVs和GVs两类，NPVs的包涵体呈多角体形，内 有多个病毒粒子，而GVs的包涵体呈颗粒体形，内只有一个病毒粒子。 通过扫描电镜可以观察到纯化的PsGV的包涵体形状规则，大小比较均一，长度约为0．59M， 直径为0．39M。通过透射电镜可以观察到每个包涵体内部有一个杆状病毒粒子，长约310rim，宽 约40nln，每个病毒粒子内只有一个核衣壳。 II的包涵体形状不太规则，大小也不均一，直径约 通过扫描电镜可以观察剑纯化的SpltNPV 1．3…Vl。在透射电镜下可以观察到每个包涵体内部有多个杆状病毒粒子，长约260rim，宽约50nm， 每个病毒粒子内含有多个核衣壳。 2．PsGV的基因组全序列分析 基冈组具有很高的序列相似性和共线性，而且这三个基因组均有9个hrs，它们的结构以及在基因 的重复基因(ORF39和49)，并通过PCR扩增进行了验证。 结果可以判定其属于一种新的颗粒体组成蛋白。 U的基因组全序列分析 3．SpltNPV 11)基冈组全序列，表明这是一个新的杆状 测定和分析了斜纹夜蛾核型多角体病毒(SpltNPV I同源，133个与SeMNPV同 具有一定的同源性，包括97个与AcMNPV同源，96个与SpltNPV II基因组中有8个 源，这些同源基因的氨基酸相似性分别为41．4％、44．6％和76．5％。在SpltNPV II基因组中还有2个重复的ORFs： 特有的ORFs和7个hrs。除了2个bro基因以外，在SpltNPV p26和odv—e56，系统进化分析结果表明这两个基因的每个重复的来源都不同。 I是从相同的宿主分离到的两种杆状病毒，对它们的基因组进行了比较， SpltNPVⅡ和SpltNPV 包括基冈组大小、ORFs数目、G+C含量、基因内容、基因顺序和氨基酸序列相似性，发现它们 之间存在非常显著的差异。结合之前的杀虫效果和限制性酶切图谱分析结果(与苏州大学朱江教 I的新病毒。 11是一种不同于SpltNPV 授交流)，认为SpltNPV H的系统进化分析 4．PsGV和SpitNPV 迄今为止，已知有45种杆状病毒的基因组全序列进行了测定，它们共有29个保守的基冈， 被认为是杆状病毒的核心基因，这些基因通常编码最基本的功能。本研究建立了基于这29个核心 基因的氨基酸序列按照一定的顺序连接后的系统进化树，这个进化树支持了将杆状病毒分为鳞翅 目NPVs、鳞翅目Gvs、膜翅目杆状病毒和双翅目杆状病毒的最新建议分类系统，其中鳞翅目NPVs 又分为GroupI和Group XecnGV的进化关系最近，这与本文第四章中比较的结果是一致的。从这个系统进化树还可以看 II I NPVs，与SeMNPV关系最近。虽然SpltNPVII与SpltNPV 出：SpltNPVII属丁鳞翅目Group