文昌鱼GNBPLITAF基因进化、功能及免疫相关microRNA比较转录组分析.pdf

摘要 摘要 形态学以及分子生物学的证据表明文昌鱼是脊索动物中的基底生物，是研究脊椎 动物形态、发育以及免疫系统的起源与进化的重要模式生物。随着比较免疫学的迅速 发展，以及佛罗里达文昌鱼基因组测序的完成，关于文昌鱼免疫的研究越来越引起人 们的关注。因此，本论文在文昌鱼EST数据库的基础上以文昌鱼免疫相关基因LITAF、 比较基因组学以及免疫生物学等检测手段得到以下几个方面的研究结果： 1．本论文首先系统的对文昌鱼五个发育阶段的EST序列进行了比较分析，通过聚类 白序列相匹配。同时也对不同发育阶段的基因进行了GO功能注释，结果显示在神 可能与免疫相关的基因，为后续免疫基因功能的研究提供了数据基础。此外，我 EST数据库http：／／rich．yunda．org／test／amphioxusest／。 2．GNBP蛋白是一个重要的模式识别蛋白，能够驱使宿主抵御病原微生物的入侵。 个氨基酸，序列分析表明该基因包含一个保守的D．1，3．葡聚糖识别与结合结构域， 与其它物种不同的是该基因还包含两个额外的WSC结构域。对该基因的组织表达 模式分析发现该基因主要是在文昌鱼的免疫组织肝盲囊及肠中高表达。脂多糖 与进化提供了基础。 及一些其它炎症因子的表达。本论文首次在白氏文昌鱼中克隆得到了一个LITAF 基因的空间表达模式分析发现，该基因在肝盲囊和肠中高表达，在肌肉、鳃及性 腺中次之，而在脊索中的表达量最低。LPS刺激实验表明在文昌鱼中LPS能够在一 Abstract evidenceshowthat isthebasalchordate Both andmolecular amphioxus morphological crucial for thechordateevolution the of andisa organismunderstanding includingorigiIl and the of theilnlTlUne development development．Withrapid system，morphology wellasthe oftheBranchiostoma comparativeimmunology，ascompletion floridae attentionWasfocusedon immune this increasingly．In genomesequencing，the amphioxus ontheESTsof molecular PCR cloning，real-time study．based amphioxus，using and studiedthe immunobiologytechnology，we microarray，comparativegenom