斑背大尾莺线粒全基因组研究及其种群遗传结构分析.pdfVIP

斑背大尾莺线粒全基因组研究及其种群遗传结构分析.pdf

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斑背大尾莺线粒全基因组研究及其种群遗传结构分析.pdf

Code:10225 University Code:S14606 Register for Dissertationthe ofMaster Degree Researchof mitochondrialand complete genome structureof Marsh populationgenetic Japanese rbler(Meguluspryeri) Candidate: RongRong ProfessorLi Supervisor: Feng Associate Supervisor: Academic for:Master DegreeApplied Speciality: Zoology DateofOralExamination:June,2014 Northeast University: ForestryUniversity 万方数据 摘要 摘要 采用长PCR扩增和二代测序相结合的方法对斑背大尾莺线粒体基因组全序列进行扩 rRNA)、PCGs 增并注释。将序列划分为3个不同数据集:rRNAs数据集(12SrRNA和16S 数据集(13个蛋白质编码基因)和rRNAs+PCGs+CR数据集(12SrRNA、16SrRNA、 13个蛋白质编码基因和部分控制区序列)对分布在我国6个繁殖地和2个越冬地的38 个样本的遗传多样性和种群遗传结构进行分析。 1.斑背大尾莺线粒体基因组全序列 基含量为A29.7%、T24.1%、C31.9%、G 14.3%,A+T%略大于C+G%。蛋白质编码基 臂缺失,其余所有tRNA均能形成典型的三叶草结构,斑背大尾莺存在两个控制区。 2。遗传多样性分析 对2个rRNA、13个蛋白质编码基因和控制区的单倍型及其多样性进行分析,斑背 范围为O.00056.0.00485,平均值为0.001 1.6243。与同一亚科下的相近种东方大苇莺(Acrocephalus 色山雀(Parus 传多样性多处于较低水平。 3.种群遗传结构分析 网络图看出,除ST种群分化明显外,其他种群并未按地理种群聚集在一起,而是各个地 可知,我国境内的斑背大尾莺种群并未发生分化,仍属于同一个种。 关键词斑背大尾莺;线粒体全基因组;遗传多样性;种群遗传结构 万方数据 Abstract Abstract

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