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生物信息学数据库 信息检索教研室 薛晓芳 2010年11月2日 生物信息学概念 生物信息学是对生物学数据进行收集、处理、存储、检索和分析的一门交叉学科 研究生物信息的采集、处理、存储、传布、分析和解释等各个方面，通过综合数学、计算机科学和生物学的工具与技术来揭示大量而复杂的生物数据所赋有的生物学奥秘 研究目标是发展和利用先进计算技术解决生物学难题 生物信息学数据库 大量生物学数据的存储和利用离不开数据库 用于结构化存储生物数据，以便进一步对数据进行分析和利用 数据库的数据来源 两大主要来源 经典的生物医学研究：大量生物医学科研工作者根据自己的兴趣开展的个别研究 大规模组学研究：代表性工作是大规模人类基因组学和蛋白质组学研究 经典生物医学研究 针对某较小领域开展深入研究，采集的生物学数据 对大量零碎的生物学数据，进一步收集、整理和利用，对推动生物医学的研究有重要意义 最具代表性的是KEGG数据库，该数据库整理收录了大量代谢网络（PATHWAY）的研究成果，描绘了生物体内代谢网络涉及的各种分子及关系 大规模组学研究 上世纪90年代初启动人类基因组计划，短时间内产生海量生物学数据 随着基因组计划进行，多种相关高通量研究逐渐开展起来 基于表达序列标签（EST）和DNA微阵列的高通量转录组研究 基于生物质谱的蛋白质组表达谱和修饰谱研究 基于酵母双杂交等技术的高通量蛋白质-蛋白质相互作用组研