蛋白质相互作用数据库及其应用_余鑫煜.pdfVIP

ISSN 中国生物化学与分子生物学报 2008 年 3 月 CN 　113870Q Chinese Journal of Biochemistry and Molecular Biology 24 (3) :189～196 ·综述 · 蛋白质相互作用数据库及其应用 1) 1) ,2) 余鑫煜 , 　许正平 ( 1) 2) ) 浙江大学 医学院环境医学研究所 , 医学院环境基因组研究中心 , 杭州 　310058 摘要 　对蛋白质相互作用及其网络的了解不仅有助于深入理解生命活动的本质和疾病发生的机 制 ,而且可以为药物研发提供靶点. 目前 ,通过高通量筛选 、计算方法预测和文献挖掘等方法 ,获得 了大批量的蛋白质相互作用数据 ,并由此构建了很多内容丰富并 日益更新的蛋白质相互作用数据 库. 本文首先简要阐述了大规模蛋白质相互作用数据产生的3 种方法 ,然后重点介绍了几个人类相 关的蛋白质相互作用公共数据库 ,包括 HPRD 、BIND 、IntAct 、MINT 、DIP 和 MIPS ,并概述了蛋白质相 互作用数据库的整合情况以及这些数据库在蛋白质相互作用网络构建上的应用. 关键词 　蛋白质相互作用 ;蛋白质相互作用数据库 ; 网络构建 中图分类号 　Q8114 An Introduction to ProteinProtein Interaction Database and Its Application 1) 1) , 2) YU XinYu , XU ZhengPing ( 1) Institute of Environmental Medicine , 2) Research Centerf or Environmental Genomics , Zhej iang University School of Medicine , Hangzhou 　310058 , China) Abstract 　The better understanding of proteinprotein interactions is crucial for elucidating the structural functional relations of proteins , investigating their roles in associated disease development , and determining potential drug targets for clinical applications. A vast number of proteinprotein interactions have been identified and the information was organized and hosted in many proteinprotein interaction databases with the help of high throughput screening technologies , computational predictions and literaturemining processes. This revi