应用PLS-QSAR模型预测纳米金属氧化物的毒性.pdfVIP

2015 年 9 月 第 27 卷 第 5 期 技术与方法 The application of PLS-QSAR 应用PLS-QSAR model to predict the toxicity 模型预测纳米金属 of nanometer metal oxide 氧化物的毒性 邓景景，王 萌，唐 萌， DENG Jingjing，WANG Meng，TANG Meng， * 刘 冉，闵 捷，余小金 LIU Ran，MIN Jie，YU Xiaojin* （东南大学公共卫生学院，江苏 南京 210009） (Department of Preventive Medicine, School of Public Health, Nanjing 210009, Jiangsu, China) 【摘要 】目的： 探讨基于偏最小二乘法(PLS)的定量构效关系(QSAR)模型(即PLS-QSAR模型)在纳米金属氧化物细菌毒性预测中的应 用策略，为同类毒理学研究提供新的方法学选择。方法：应用PLS-QSAR模型分析纳米金属氧化物的结构描述符与细菌毒性之间 的关系，分别采用3种主成分确定方法和4种变量选择方法建立模型，并对所建模型进行内部验证和外部验证，评价模型的预测能 力和可解释性，以确定最优模型。结果：结合变量重要性指标(VIP)和交叉验证指标的向前变量选择法(FPVQ)和基于检验的主成分 2 2 2 确定方法(CVtest)得到的模型，拟合能力(R =0.974)、稳定性(Q CV=0.951)、预测能力(Q EXT=0.775)方面均较好。结论：PLS-QSAR模型 可作为一个重要的方法用于纳米金属氧化物的毒性预测，对于变量选择和主成分确定的策略需要结合数据特征具体探讨。 【关键词 】偏最小二乘法；定量构效关系；纳米金属氧化物；毒性 中图分类号：R114 文献标志码： A 文章编号： 1004-616X(2015)05-0399-05 doi: 10.3969/j.issn.1004-616x.2015.05.015 【ABSTRACT 】OBJECTIVE: To explore the application of partial least squares-quantities structure activity relationship (PLS-QSAR) model to predict the bacterial toxicity of nanometer metal oxide，in order to provide methodological support for toxicology research. METHODS ：We built 12 models through 3 ways to determine principal components and 4 w