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- 约 64页
- 2015-11-22 发布于安徽
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摘要
摘要
蛋白激酶PKC0在细胞信号传导过程中发挥着重要的作用。它与很多生理
功能和疾病有着密切的关系,这使得PKC0成为了一个重要的靶标。目前的研
究已经发现,PKC0活性环上Thr538位点的磷酸化修饰,对于蛋白激酶的活性
起着十分重要的作用。为了解释Thr538位点磷酸化修饰对PKC0结构的作用,
本文通过分子动力学模拟和分子对接的方法进行了相应的研究。本文的研究工
作主要包括:
1,首先利用lxjd和2jed作为模板,利用多模板同源建模方法,补全了PKC0
到的模型进行了评价,这些评价结果证明该模型是十分可靠的。
2,Thr538位点的突变能够导致PKC0催化亚基局部结构发生变化。分子
模拟结果的RMSD表明Thr538位点的磷酸化能够提高催化亚基的稳定性。
点突变对于催化亚基整体的结构不会形成太大的变化。PKC0氨基酸残基在
1的RMSF数值
Lys409、Asp504、Phe395、Asp522、Met444、Asp544、Asp56
具有较大柔性。
3,模拟结果表明Thr538位点处于磷酸化状态时,538位点氨基酸残基能
磷酸化修饰能够对PKC0活性区域处的结构产生很大的影响,尤其是在甘氨酸
富集区。模拟表明当Thr538位点为磷酸化状态时,催化亚基结构状态为开放状
态;当Thr538位点去磷酸化时,催化亚基结构状态为闭合状态;当Thr538位
点突变为Glu时,催化亚基结构状态处于中间状态。
4,利用分子对接技术,本文给出了ATP与PKC0的结合构型,并对ATP
与PKC0两者间的氢键和疏水作用进行了分析。
关键词:PKC0,分子动力学模拟,突变,分子对接
Abstract
Abstract
Protein an roleinthecell
kinaseCO-type(PKCO)playsimportant signaling
correlateswith functionsanddisease
process.It manyphysiological closely,which
makesittobean hasbeenknownthatthe
importanttarget.It phosphorylated
modificationofsitesThr538onPKCO an rolefor
activityloopplaysimportant
kinase thestructural ofPKC0withthe
protein activity.Toexplore impacts
ofThr53 molecular simulationsand
modification
phosphorylated 8,the dynamics
been in
molecular were staffhas fulfilled
dockingtechniqueapplied.Thefollowing
thisdissertation:
coordinatesofPKC0were
1,Firstly,withmultipletemplates
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