单线态氧损伤2%27-脱氧鸟苷和8-氧代脱氧鸟苷机理理论的研究.pdfVIP

单线态氧损伤2%27-脱氧鸟苷和8-氧代脱氧鸟苷机理理论的研究.pdf

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摘要 摘要 ‘本文采用密度泛函理论研究了单线态氧作为自由基氧化损伤DNA碱基的两 个反应机理。课题一是单线态氧氧化损伤2’~脱氧鸟苷的反应机理;课题二为 单线态氧损伤8一氧代脱氧鸟苷的反应机理。 第一课题是单线态氧与2’一脱氧鸟苷反应生成螺环亚胺基二乙内酰脲 下对单线态氧和27一脱氧鸟苷的反应机理进行了研究。此反应机理分为两个阶 段:第一阶段是单线态氧从正反两面进攻27一脱氧鸟苷(路径a和b)生成过氧 化中间体,此步属于[4+2]环加成反应,首先采用自然轨道(NBO)分析了它的 电荷,发现该步的[4+2]环加成是极化的环加成反应。其次,对过渡态的键长也 进行了分析,结果同样证实了该步的环加成反应是非协同的过程。第二阶段是 过氧化中间体经由四条不同的反应路径生成最终的产物,它们是一对同分异构 体螺环亚胺基二乙内酰脲(路径1、路径2、路径3和路径4)。计算结果表明, 路径4是反应发生的最优通道,并且发现dSp(R)比dSp(S)稳定,这与实验事实 相吻合。 第二课题是单线态氧与8一氧代脱氧乌苷反应生成螺环亚胺基二乙内酰脲 (dSp)的反应机理研究。在此课题中,首先使用密度泛函考察了syn(anti).8. 氧代脱氧鸟苷的烯醇互变异构,设计了两条路径(路径l,路径2),路径l与 路径2的区别是在路径2中加入了H20分子。计算结果表明,路径2是最优反 应通道,说明H20分子在反应过程中是作为质子交换的媒介,加快了反应进程。 其次运用密度泛函理论对8.氧代脱氧鸟苷和单线态氧的反应机理进行了研究。 我们设计了路径3和4从正反两面进攻8一氧代脱氧鸟苷形成过氧化中间体,此 步是一个[2+2]的环加成反应,通过对过渡态的键长分析,结果表明此步的环加 成反应是非协同的过程。接着反应沿着这两条通道往下进行生成最终产物dSp, 但在此过程中有一步涉及光反应,需要利用激发态来寻找其过渡态,目前对此 步的计算我们还在摸索中,对于最终生成的产物dSp(R)和dSp(S)来说,仍是 dSp(R)相对稳定,与实验事实相符合。 关键词:密度泛函理论,单线态氧,27一脱氧鸟苷,8一氧代脱氧鸟昔,反应机,[4+2] 环加成,[2+2]的环加成 Abstract Abstract Inthis functional calculationshavebeen paper,densitytheory carriedout fOFa3 to thereactionmechanismof asafreeradical study singletoxygen oxidative damage toDNAbases.Thefirst oneiSthereactionmechanismon oxidative singletoxygen to thesecondoneiSthereactionmechanismof damage2-deoxyguanosine.And to singletoxygendamage8一OXO—deoxyguanosine. Thereactionmechanismsof with the singletoxygen2-deoxyguanosineby reactionof wasstudied functionalatthe spiroiminodihydanto

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