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摘要
摘要
近年来,动物线粒体DNA全序列的测定和系统发生关系的重建己成为分子
系统学研究的热点之一,尤其是线粒体DNA全序列已经广泛应用于鸟类的系统
学研究上,已成功用于解决某些鸟类类群的系统发生关系。雁形目(Anseriformes)
鸟类是一个庞大的类群,其系统发育关系及部分物种的分类地位复杂且具有争
议,也是鸟类系统学研究关注的焦点。由于雁形目种类繁多,目前不同的研究方
法得到的雁形目鸟类的系统发生关系均存在较大的分歧,甚至各个阶元的系统发
生关系等并不一致。长期以来,雁形目中一些重要物种的分类地位一直存在争议,
如中华秋沙鸭(Mergussquamatus)、豆雁(Anser
ferruginea)和鸳鸯(Aixgalericulatata)等物种的分类归属及亲缘关系是争论的
焦点之一。此外,雁形目鸟类中的一些重要类群的分类地位及系统发生关系也存
在争论,如鹊雁(Anseranas ducks)和树鸭
semipalmata)、针尾鸭(Stiff-tailed
(Whistling
生关系也受到关注。传统的形态学研究对雁形目鸟类的系统发生关系存在较大的
分歧,而这些争论仅仅从形态学上的证据难以得到解决。随着基因组学分析技术
的发展和分子系统学研究的深入,线粒体DNA全序列作为重要的分子标记已经
广泛用于研究物种之间的亲缘关系、推导物种的进化和系统发生关系。为了进一
步澄清雁形目部分物种的分类地位和雁形目鸟类的系统发生关系,本研究选取了
中华秋沙鸭、豆雁、赤麻鸭和鸳鸯的线粒体DNA全序列作为研究对象。根据已
知的雁形目鸟类的线粒体DNA全序列设计引物进行PCR扩增,获得四种雁形目
鸟类线粒体DNA全序列,分析其结构和特征,进一步研究雁形目鸟类线粒体基
因的排列模式和结构,为雁形目鸟类线粒体谱系基因组学的研究提供新的数据资
料。结合NCBI数据库上已有序列重建的16种雁形目鸟类的系统发育树,澄清
b,ND2和COI)
四种雁形目鸟类的分类地位。同时,以部分线粒体基因序列(Cyt
为联合标记基因,重建68种雁形目鸟类的系统发生树,探讨部分争议物种类群
的分类地位,从分子系统学的角度为雁形目系统发育提供证据,以期为雁形目鸟
类系统分类与进化研究提供新的信息。
四种雁形目鸟类的线粒体DNA全序列均为典型的环状分子结构,其长度分
l
四种雁形目鸟类的线粒体全基因组结构特征及其分子系统学研冗
595 688 651 639
别为16 bp、16bp、16bp和16bp,包括37个基因:13个蛋白
b)、2个rRNA基因
质编码基因(NDl.6、ND4L、ATP6、ATP8、COI-III和Cyt
(16SrRNA和12S
四种雁形目鸟类的线粒体DNA各基因长度、位置与己知雁形目鸟类相似,其编
码蛋白质区域和rRNA基因与其它雁形目鸟类具有很高的同源性,显示其线粒体
起始密码子,终止密码子以典型的A,T-或TAG为主。非编码区包括少量的
型的三叶草结构。2个rRNA基因(16SrRNA和12S
之间,并以tRNATM间隔。
以线粒体DNA全序列为分子标记构建的16种雁形目鸟类的系统发生树显示
鸳鸯和赤麻鸭应同属于麻鸭亚科(Tadominae);中华秋沙鸭隶属于鸭亚科
发生树中与其他鸭族物种相距较远,其分类地位还需要进一步研究。
b,ND2和COI)构
利用已知雁形目鸟类线粒体的三种联合标记基因(Cyt
建的68种雁形目鸟类的系统发育树结果表明:雁形目鸟类可以划分为三个科,
作为一个单独的科;鸭科划分为五个亚科:鸭亚科(Anatinae)、麻鸭亚科
绒鸭族从海鸭族中分离出来构建单独的一个族;麻鸭亚科包括A/x、Cairina、
族。
关键词:雁形目鸟类,线粒体DNA,线粒体基因组结构,分子系统树,系统发
育
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