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演化超网络在多类型癌症分子分型中的应用

第 35卷第 1O期 电 子 与 信 息 学 报 、 1.35NO.10 2013年 10月 JournalofElectronics&InformationTechnology 0ct.2013 演化超网络在多类型癌症分子分型中的应用 王 进 丁 凌 孙开伟 李钟浩 (计算智能重庆市重点实验室(重庆邮电大学) 重庆 4000651 (t4国仁荷大学信息与通信工程系 仁川 402—7511 摘 要:该文提出一种用于多类型癌症分子分型的演化超网络模式识别方法。首先采用 “一对多”方法,将一个多 类分型问题转化为多个二类分型问题;然后利用信噪比方法对DNA微阵列数据进行信息基因选择:经过超网络对 训练集的演化学习,构造一系列二类分类器并进行集成,最终构建一个多类型癌症分型系统并对待测样本进行分类。 对急性白血病、儿童小圆蓝细胞肿瘤和 GCM 数据集实验结果表明:演化超网络留一交叉验证fL00CV)识别率分 别为:98.61%,100%和 85.35%。演化超网络有利于挖掘癌症相关基因,具有 良好的学习结果可读性。 关键词: 模式识别;机器学习;演化超网络;微阵列;癌症多类型分类 中图分类号:TP18;TP39 文献标识码: A 文章编号:1009—5896(2013)102425—07 D0I:10.3724/SP.J.1146.2012.O1171 ApplyingEvolutionaryHypernetworksforM ulticlass M oleculra Classification ofCancer W angJin① DingLing① SunKaiwei① LeeChongho② — (ChongqingKeyLaboratoryofComputationalIntelligence(ChongqingUniversity ofPostsandTelecommunications),Chongqing400065,China) (DepartmentofInformationandCommunicationEngineering,InhaUniversity,Incheon402—751,RepublicofKorea) Abstract:Thispaperpresentsapatternrecognitionmethodformulticlasscancermolecularclassificationusing evolutionaryhypernetworks.A multiclassclassificationissueisdecomposedintoasetofbinaryclassificationissues byOne—Versus—All(OVA)approach.Thesignal—to—noiseratiomethodisemployedofrinformativegenesselection from theDNA microarray.A seriesofbinaryclassifiersa

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