蛋白质合成(郭蔼光主编配套课件).pptVIP

13.1 蛋白质合成体系 蛋白质合成过程中需要200多种生物大分子参加，包括核糖体、mRNA、tRNA及多种蛋白质因子。 mRNA分子上以5‘→3’方向，从AUG开始每三个连续的核苷酸(三联体)组成一个密码子(codon) 。 核糖体结合技术 遗传密码字典 AUG是起始密码子，也是Met(或fMet)的密码子。 原核和真核生物肽链合成的第一个氨基酸都是Met(或fMet)；少数细菌中也用GUG做为起始码(起始位点编码fMet，密码表中编码Val)。真核生物偶尔也用CUG作起始蛋氨酸的密码。 密码子UAA、UAG、UGA 是肽链成的终止密码子，不代表任何氨基酸，也称无意义密码子。 现代研究发现终止密码子也可编码氨基酸： No21：UGA：硒-半胱氨酸 No22：UAG：吡咯-赖氨酸 2. 连续性 (commaless) 3. 简并性 (degeneracy) 4.通用性 (universal) 蛋白质生物合成整套密码，从原核生物到人类都通用。密码的通用性进一步证明各种生物进化自同一祖先。已发现少数例外，如动物的线粒体、植物的叶绿体。 6.变偶性或摆动性(wobble) “摆动假说”认为：碱基间除标准配对外，还可以有非标准的配对。 反密码与密码碱基配对时的摇摆现象 功能：主要起转运氨基酸的作用。由于tRNA分子的同工性，细胞内tRNA的种类比氨基酸的种类多。 MW 25～30kD，沉降常数约4S，约80个核苷酸组成，含有大量稀有碱基，如ψ、DHU,各种甲基化的嘌呤和嘧啶核苷等。原核和真核细胞1个tRNA分子一般有10～15个稀有碱基。 tRNA中有15～16个核苷酸的种类和位置不变，为固定核苷酸，其它的为可变核苷酸。 TψC环；由7个碱基组成，参与tRNA与核糖体表面的结合。 额外环或可变环( extro variable loop)。碱基种类和数量(3～18个碱基)高度可变，并富含稀有碱基。 反密码子环(anti-cordon loop)。由7个碱基组成，处于中间位的3个碱基为反密码子。反密码子可与mRNA中的密码子结合。毗邻反密码子的3‘端碱基往往为烷化修饰嘌呤,其5’端为U,即：U-反密码子-修饰嘌呤。 二氢尿嘧啶环(D-loop)由8～12个碱基组成，含有2±1个修饰的碱基(D)。 倒L中反密码子环和二氢尿嘧啶环参与识别氨酰-Trna 倒L中TψC环参与核糖体 tRNA的三维结构呈倒“L”形。 氨基酸接受臂CCA序列和反密码子处于倒L的两端。 D环和TψC环形成倒L的角。不同tRNA倒L形的角有轻微改变，允许tRNA执行不同功能时改变其功能。 核糖体分两类： 一类核糖体附着于粗面内质网,参与分泌性蛋白质的合成； 另一类游离于胞浆，参与细胞固有蛋白质的合成。 13.1.3.1 核糖体的组成 组成核糖体的rRNA为单股链，可自行折叠形成螺旋区和环区，所有螺旋区的碱基都是保守的； 所有来源rRNA均能形成4个结构域(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ)，每个结构域均含许多茎和环，它们通过无距离碱基对的相互反应彼此靠近； 绝大多数rRNA碱基的特异功能尚不清楚。可能rRNA中不配对碱基涉及到rRNA与其它RNA的结合，如16S的3端不配对碱基与mRNA的起始部位(SD顺序)形成碱基配对。 ①核糖体蛋白：与rRNA或核糖体亚基紧密连接的蛋白。 如E.coli 30S亚基上的21种蛋白质及50S亚基上的34种蛋白质(共54种，小亚基上的S20与大亚基上的L26是相同)，真核细胞40S亚基上的30种蛋白质及60S亚基上的45-50种蛋白质(共约80种)，都属核糖体蛋白质。 ②核糖体相关蛋白质：(proteins associated with ribosome；PAR) 与核糖体亚基疏松缔合，对核糖体循环发挥调节作用蛋白. 如起始因子(IF或eIF)和延长因子(EF)等。PAR不是构成核糖体的固有成分。 mRNA结合位点： 位于30s小亚基头部，负责与mRNA的结合，特别是16srRNA的3’-端与mRNA的AUG之前的一段序列互补是这种结合必不可少的。 A位点：(Aminoacyl-tRNA site) 结合新进入的氨基酰-tRNA的位置。大部分位于大亚基而小部分位于小亚基。 P位点：(peptidyl-tRNA site) 结合起始tRNA并向A位给出氨基酸位置。又称肽酰基-tRNA位或给位,大部分位于小亚基,小部分位于大亚基. 原核细胞70S核糖体的A位、P位及mRNA结合部位示意图 播放动画…… 在蛋白质生物合成中，各种氨基酸在参入肽链之前必须先经过活化，然后再由其特异的tRNA携带至核糖体上，才能以mRNA为模板缩合成肽链。 氨基酸活化后与相应的tRNA结