黄渤海沉积物真菌分子多样性及其新种鉴定.pdf

黄渤海沉积物真菌分子多样性及新种鉴定 物真菌Shannon-Wiener 多样性指数无显著差异。子囊菌门粪壳菌纲和座囊菌纲、 担子菌门伞菌纲为优势类群。 同一海域的沉积物样品具有相似的真菌群落结构。调查范围内，纬度由低到 高，各海域真菌多样性大致呈现由高到低的梯度变化，即南黄海、北黄海、渤海 的真菌群落组成复杂度依次降低。影响黄渤海沉积物真菌群落组成的最重要的环 境因子为TN、C/N、pH 。 尽管以ITS1 和ITS2 作为分子标记，在高级分类介元上能得到类似的分类学 结果，但后续多样性和群落结构分析存在一定程度的差异，PCR 扩增的偏好性 是其中最主要的原因。ITS1F/ITS2 因其良好的真菌特异性，因而可以扩增得到更 多的真菌序列；其片段长度更长，信息位点更多，且平均变异程度更高。本研究 结果也表明，在分析真菌群落结构和多样性时，ITS1 优于ITS2 。随着测序成本 的不断降低，同时采用两个片段进行测序分析，互为补充，可能得到更加准确的 结果。同时，应考虑singletons 和doubletons 的处理方法，以减少偶见种对多样 性分析的影响。 此外，本研究采用形态学和分子系统学相结合的方法，对分离自黄海山东沿 岸潮间带海藻（内生真菌）或沉积物的疑难真菌进行形态学描述和系统发育分析， 鉴定出三个新种 Phaeoisaria sedimenticola 、Ascotricha longipila 、Ascotricha parvispora 和一个新组合种Ascotricha sinuosa 。除Phaeoisaria sedimenticola 为无 性型外，其余均为全型。通过探讨刺囊壳属（Ascotricha ）的系统发育地位及其 无性型，明确了刺囊壳属应归于炭角菌科（Xylariaceae ）炭角型类群 （Xylarioideae ），其无性型是双聚散霉属（Dicyma ），汉斯霉属（Hansfordia ）可 能与刺囊壳属有关。 关键词：分子系统发生；焦磷酸测序；真菌多样性 2 万方数据 黄渤海沉积物真菌分子多样性及新种鉴定 Fungal Molecular Diversity in Marine Sediments Collected from the Yellow and Bohai Sea and New Species Identification Abstract Marine sediments samples were collected from the Bohai and Yellow Sea in Jun, 2013. Metagenomic DNA was extracted, and analyzed by high-throughput 454 pyrosequencing. ITS1 and ITS2 were used as metabarcodes for fungi. High-quality reads were clustered into operational taxonomic units (OTUs) according to 97% sequence similarity. Community Similarity and fungal diversity are studied at