碱基不同配对构型氢键作用机理及其电子特性理论的研究.pdfVIP

碱基不同配对构型氢键作用机理及其电子特性理论的研究.pdf

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目 录 目 录 摘要……………………………~…………………………………………………I Abstract……………………………………………………………………………………………………..III 第一章序言………………………………………………………………………….I I.1研究氢键的意义………………………………………………………………….1 1.2解释氢键的几种理论……………………………………………………………2 1.2.1 Hobza的两步机理:…………………………………………………..2 1.2.2分子内超共轭………………………………………………………….2 1.3研究内容的确定…………………………………………………………………3 参考文献……………………………………………………………………………一4 第二章理论基础和计算方法………………………………………………………..6 2.1应用程序……………………………………………………………………一6 2.1.1 Gaussian程序简介…………………………………………………….6 2.1.2 Multiwfn程序简介…………………………………………………….6 2.2Hartree-Fock(HF)理论………………………………………………………………………….7 Functional 2.3.密度泛函理论(Density Theory,DFT)…………………………….8 2.4分子表面静电势定量分析………………………………………………….10 Bond 2.5自然键轨道(Natural Orbital,NBO)理论……………………………..13 In 2.6分子中的原子(AtomsMolecules,AIM)理论…………………………….14 参考文献………………………………………………………………………..15 第三章沃森一克里克碱基对氢键作用机理及其稳定性密度泛函理论研究………17 7 3.1引言…………………………………………………………………………l 8 3.2计算方法……………………………………………………………………l 3-3结果与讨论…………………………………………………………………18 8 3.3.1结构及能量分析………………………………………………………l 3.3.2频率改变及红外光谱分析……………………………………………20 3.3.3自然键轨道(NBO)分析………………………………………………22 3.3.4表面静电势分析………………………………………………………23 3.3.5 RDG函数等值面图形化研究弱相互作用……………………………25 3.3.6跃迁密度矩阵及前线分子轨道分析…………………………………26 3.3.7拓扑性质……………………………………………………………..28 西南大学硕士学位论文 1 3.4结论………………………………………………………………………………………………..3 1 参考文献……………………………………………………………

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