生物信息学及在寄生虫遗传变异和进化分析上的应用.pptVIP

生物信息学及其在寄生虫遗传变异和进化分析上的应用 李娟 2009128010 Introduction to Bioinformatics 一、生物信息学的来源 Introduction to Bioinformatics 二、生物信息学的准确概念 生物信息学自诞生以来，大致经历了以下三个阶段: 前基因组时代: 标志性工作包括生物数据库的建立、检索工具的开发以及DNA 和蛋白质序列分析; 基因组时代: 标志性工作包括基因寻找和识别、网络数据库系统的建立和交互界面的开发; 后基因组时代: 标志性工作是大规模基因组分析、蛋白质组分析以及各种数据的比较和整合。 一方面是实验数据即核苷酸和氨基酸序列的获得、处理、贮存以及在互联网的传输、共享。 另一方面是数据的搜索、分析和注解，从而诠释数据中所蕴含的生物学意义。 由此引发生物信息学的研究重点主要体现在基因组学（Genomics）和蛋白组学（Proteomics）两个方面上。 一级数据库 直接来源于实验获得的原始数据，只经过简单的归类、整理和注释。 一级核酸数据库：GenBank数据库、EMBL数据库、 DDBJ数据库 一级蛋白质序列数据库：SWISS-PROT库、PIR库 一级蛋白质结构数据库：PDB库、SCOP库、CATH库 GenBank（美国国家生物技术信息中心，NCBI）