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牡丹开花调控转录因子基因PsCOL4的克隆、表达与系统进化分析.doc

牡丹开花调控转录因子基因PsCOL4的克隆、表达与系统进化分析.doc

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牡丹开花调控转录因子基因PsCOL4的克隆、表达与系统进化分析

园 艺 学 报 2014,41(7):1409–1417 http: // www. ahs. ac. cn Acta Horticulturae Sinica E-mail: yuanyixuebao@126.com 收稿日期:2013–12–23;修回日期:2014–06–13 基金项目:中国农业科学院院所基金项目(2060302-2-12);国家‘863’计划项目(2011A;国家公益性行业(农业)科研 专项(201203071);中国农业科学院科技创新工程项目(2013-2014);农业部园艺作物生物学与种质创制重点实验室项目 * 通信作者 Author for correspondence(E-mail:zhxiuxin@163.com) 牡丹开花调控转录因子基因 PsCOL4 的克隆、表 达与系统进化分析 王顺利,薛璟祺,朱富勇,张 萍,任秀霞,刘传娇,张秀新* (中国农业科学院蔬菜花卉研究所,北京 100081) 摘 要:采用RT-PCR方法从‘紫罗兰’牡丹( Paeonia suffruticosa ‘Ziluolan’)花芽中克隆得到1 个重要开花调控转录因子基因 CONSTANS-like ,其cDNA全长1 125 bp,编码373个氨基酸。序列比对和 结构域分析表明,此蛋白包含两个B-box型锌指结构和1个CCT结构域,与拟南芥的AtCOL4最为相似, 将其命名为 PsCOL4 ,GenBank登录号为KF113358。系统进化树分析表明,PsCOL4与葡萄编码的VvCOL4 的亲缘关系最近,属于第1群组CO类似基因。实时定量PCR表明, PsCOL4 在不同组织器官中均有表 达,其中茎和叶中的表达量最高,根中最低。在花芽不同发育时期, PsCOL4 的表达呈现递减趋势。不同 光周期条件下, PsCOL4 的表达稍有不同,短日照条件下在叶中的表达有所增加,茎中稍有减少。 关键词:牡丹;光周期途径; CONSTANS 基因; PsCOL4 ;实时定量PCR 中图分类号:S 685.11 文献标志码:A 文章编号:0513-353X(2014)07-1409-09 Molecular Cloning,Expression and Evolutionary Analysis of the Flowering- regulating Transcription Factor Gene PsCOL4 in Tree Peony WANG Shun-li,XUE Jing-qi,ZHU Fu-yong,ZHANG Ping,REN Xiu-xia,Liu Chuan-jiao,and ZHANG Xiu-xin* ( Institute of Vegetables and Flowers , Chinese Academy of Agricultural Sciences , Beijing 100081, China ) Abstract:One important flowering-regulating transcription factor gene CONSTANS ( CO )was obtained from tree peony( Paeonia suffruticosa ‘Ziluolan’)by RT-PCR. The full cDNA length of PsCOL4 was 1 125 bp,and could encode 373 amino acids. Sequence alignment and motif analysis showed that the deduced amino acids contained 2 B-box zinc figure motifs near the amino terminus and 1 conserved CCT domain near the carboxy terminus. It was designated as PsCOL4 and the GenBank accession was KF113358,according to its high identity of AtCOL4 in Arabidopsis . Phylogenetic analysis showed that it has close relat

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